公开医疗数据集的人群来源与记录语言

在所查的 180 个公开医疗数据集中,人群以美国为主。人群来自美国的 74 个,加上取自 MIMIC 或 eICU 的 14 个,共 88 个,占 48.9%。人群仅来自中国的有 7 个,多是单家医院的重症与急诊记录。约一半数据集的官方说明没有写记录语言。

类型
共性研究
统计日期
2026-10-25

一、数据与方法

数据来源。 研究对象取自一份公开医疗数据集目录中标注为电子健康记录的 198 个条目。去掉重复或已并入其他条目的 7 个,以及 1 个代码仓库,得到 190 个数据集。维护方页面无法打开的 8 个、只有第三方文献描述的 2 个不纳入。其余 180 个纳入分析(图 1)。每个数据集的说明都取自维护方官网、指定数据仓储或维护方发表的数据描述论文。

图 1 数据集纳入流程

变量定义。

后五项只分两种情况:官方说明写明有,或未写明有。统计日期为 2026-10-25。各数据集的取值见对应的数据集页。

二、结果

人群地区

人群来自美国的 74 个,占 41.1%;取自 MIMIC 或 eICU 的 14 个,占 7.8%;多国的 15 个,占 8.3%(图 2)。人群仅来自中国的 7 个,占 3.9%。来自中国香港的 1 个,是香港医院管理局的数据共享平台。

纳入分析的数据集中,没有人群来自中国台湾或中国澳门的。中国台湾的全民健康保险研究数据库只有第三方文献描述。长庚研究数据库的维护方页面无法打开。这两个数据库都未纳入。

图 2 180 个数据集的人群地区

记录语言

官方说明未写记录语言的 93 个,占 51.7%。无自由文本的 47 个,占 26.1%。其余 40 个中,英语 30 个,含中文 5 个,其他语种或多语种 5 个(图 3)。

图 3 180 个数据集的记录语言

含中国、中国香港人群的 11 个数据集

表 1 列出人群仅来自中国的 7 个、来自中国香港的 1 个,以及含中国人群的 3 个多国数据集。图 4 列出这 11 个数据集是否写明有纵向记录、长期结局、标准编码、专家标注与评测基准。

表 1 含中国、中国香港人群的数据集

数据集 维护方 人群 记录来源 时间跨度 规模
PIC 儿童重症库(浙江) 浙江大学医学院附属儿童医院 浙江大学医学院附属儿童医院 ICU 的 0—18 岁儿童 诊疗记录 2010—2018 年 12,881 名患者、13,499 次住院
CHARLS 健康与养老调查 北京大学国家发展研究院、武汉大学 中国 150 个县区 45 岁及以上中老年人及其家庭 人群调查 2008 年至 2021—23 年 全国基线约 1 万户家庭、1.7 万人
浙江省人民医院重症库 浙江省人民医院 浙江省人民医院综合 ICU 与急诊 ICU 患者 诊疗记录 2012—2022 年 7,638 名患者、8,180 次住院、11,082,482 条检验记录
急诊脓毒症胸部 CT 库(浙江) 浙江省人民医院、浙江大学医学院附属邵逸夫医院 浙江省人民医院急诊收治的脓毒症患者 诊疗记录 2019—2022 年或 2012—2022 年,官方页前后不一 337 次住院、836 次胸部 CT 扫描
TCM-SD 中医证候 北京理工大学与徐州市中医院 中国中医临床就诊患者 诊疗记录 未写 54,152 份临床记录、148 种证型
广安门医院慢性胃炎库 中国中医科学院广安门医院 中国中医科学院广安门医院的慢性胃炎患者 诊疗记录 未写 6 大类 25 个模块,未给患者数或记录数
自贡重症感染库 自贡市第四人民医院等作者团队与 PhysioNet 四川自贡市第四人民医院 ICU 感染成人患者 诊疗记录 2019—2020 年 2,790 名感染 ICU 成人患者
香港医院管理局数据共享平台 香港医院管理局、EH Plus Digital(医弘数科) 医院管理局辖下公立医院与诊所的服务使用者 诊疗记录 未写 未写
ADHD-200 脑影像 ADHD-200 Consortium 8 个站点的 7—21 岁 ADHD 儿童青少年与典型发育者 研究队列 未写 776 套影像数据,含 491 名典型发育者、285 名 ADHD 患儿与青少年
RareBench 罕见病 清华大学与北京协和医院 多国公开罕见病病例与北京协和医院患者 其他+诊疗记录 未写 公开病例合计 1,197 例,PUMCH 病例总数 1,650 例
多国重症时序基准 苏黎世联邦理工学院计算机系等论文作者团队 美国、荷兰、瑞士、中国等的 ICU 与急诊患者 诊疗记录 2001—2023 年 超过 600,000 次住院或就诊,数据点接近 10 亿

图 4 11 个数据集的纵向记录、长期结局、标准编码、专家标注与评测基准

7 个中国数据集里,4 个是单家医院的重症或急诊电子病历。它们来自浙江大学医学院附属儿童医院、浙江省人民医院与自贡市第四人民医院。其中儿童重症库与浙江省人民医院重症库有同一患者的多次住院。急诊脓毒症胸部 CT 库每名患者一次住院,纵向记录是住院期间的多次 CT 与就诊。自贡库的纵向记录是住院期间的多个时点,加上出院后随访的 SF-36 问卷。

另外 3 个中,CHARLS 是全国抽样的中老年人追踪调查,各轮重复调查健康状况与医疗服务利用。TCM-SD 是中医证候辨证的评测基准,带专家标注。广安门医院慢性胃炎库的官方说明未写这五项。

香港医院管理局的数据共享平台提供住院、急诊、专科门诊等五类预定义数据集。它的官方说明也未写这五项。

3 个多国数据集都附判分规则。ADHD-200 的 8 个影像站点中,北京大学是 1 个。RareBench 的中国病例来自北京协和医院。多国重症时序基准使用了 PIC 与自贡两库。

11 个数据集中,没有一个同时写明纵向记录、长期结局和专家标注。

维护方所在国与人群地区

官方说明写明维护方在中国(不含中国香港)的有 16 个。其中 8 个的人群来自或含中国。另有 4 个由 MIMIC 的记录加工而来,原始记录来自美国波士顿一家医院。这 4 个是卒中量表文本标注集、MIMIC-IV-Ext Cardiac Disease、CliniQ与急诊分诊指令语料。其中急诊分诊指令语料的病例描述由模型改写,附表记为无真实人群。其余 4 个未写明人群地区,或不是患者记录。

反过来,ADHD-200 含中国人群,官方说明未写维护方国别。多国重症时序基准含中国人群,维护方在瑞士。按维护方所在国统计人群地区,会把这两类数据记错。

三、讨论

模型换到中国人群使用,需要本地验证数据。 在美国人群上建立的预测模型或分诊规则,用于中国患者之前,要在中国人群中检验表现。纳入分析的 7 个中国数据集,病种与场景都窄。其中 4 个是重症或急诊记录,2 个是中医数据,1 个是中老年人追踪调查。

编码体系的差异要先处理。 儿童重症库的已知局限里写明,本地 ICD-10 为 7 位扩展码,英文诊断比中文粗。在国外编码上建立的映射,用于中国数据前要做对照转换。

长期结局取决于数据能否链接。 瑞典患者登记可按个人身份号链接死因登记,韩国健保数据库的参保资格库含死亡日期。纳入分析的中国医院数据,官方说明都未写这类链接。写明有出院后结局的中国数据集是自贡库与 CHARLS,都来自研究随访。

四、局限

附表 纳入分析的 180 个数据集

序号 数据集 人群地区 记录语言
1 AACT(Aggregate Analysis of ClinicalTrials.gov) 非个体记录 官方页未写
2 ABCD Study 美国 官方页未写
3 ACI-BENCH 无真实人群 英语
4 AIPatient KG v1.0.0 美国 英语
5 Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative(ADNI) 多国 官方页未写
6 AMR-UTI: Antimicrobial Resistance in Urinary Tract Infections 美国 无自由文本
7 AmsterdamUMCdb 荷兰 其他语种或多语种
8 Annotated MIMIC-IV discharge summaries for a study on deidentification of names 无真实人群 官方页未写
9 Annotated Social Determinants of Health Dataset for Adverse Pregnancy Outcomes 美国 官方页未写
10 Annotation dataset of problematic opioid use and related contexts from MIMIC-III Critical Care Database discharge summaries 美国 英语
11 Antibiotic Resistance Microbiology Dataset Mass General Brigham 美国 无自由文本
12 ANZICS Adult Patient Database(APD) 多国 官方页未写
13 ArchEHR-QA v1.4 取自 MIMIC 或 eICU 英语
14 BedsideBench v1.0.0 无真实人群 官方页未写
15 BioBank Japan(BBJ) 日本 官方页未写
16 BioVU 与 Synthetic Derivative 美国 官方页未写
17 BOLD, a blood-gas and oximetry linked dataset 美国 无自由文本
18 BRATECA (Brazilian Tertiary Care Dataset): a Clinical Information Dataset for the Portuguese Language 巴西 其他语种或多语种
19 Breast Cancer (METABRIC, Nature 2012 & Nat Commun 2016) 多国 官方页未写
20 CancerLinQ 未写明 官方页未写
21 Cardiotocography 未写明 无自由文本
22 Chest Computed Tomography for patients with sepsis in the Emergency Department v1.0.0 中国 含中文
23 Chest ImaGenome Dataset v1.0.0 取自 MIMIC 或 eICU 英语
24 Chronic Kidney Disease 未写明 无自由文本
25 Clinical Practice Research Datalink(CPRD) 英国 无自由文本
26 Clinical Time Series Datasets for Trajectory Flow Matching Evaluation: ICU Sepsis, ICU Cardiac Arrest, and ICU GIB Cohorts 美国 无自由文本
27 CliniQ 美国 官方页未写
28 Common Longitudinal ICU data Format 多国 官方页未写
29 COPDGene Study 美国 官方页未写
30 CORAL: expert-Curated medical Oncology Reports to Advance Language model inference 美国 官方页未写
31 COVID Data for Shared Learning (CDSL) 西班牙 其他语种或多语种
32 CPIC Data 非个体记录 英语
33 Critical care database comprising patients with infection at Zigong Fourth People's Hospital 中国 含中文
34 CTU-CHB Intrapartum Cardiotocography Database v1.0.0 捷克 无自由文本
35 Curated Data for Describing Blood Glucose Management in the Intensive Care Unit v1.0.1 美国 无自由文本
36 DANDI Archive 未写明 英语
37 database of Genotypes and Phenotypes(dbGaP) 未写明 官方页未写
38 Deidentified Medical Text 美国 官方页未写
39 Discovery VIRUS COVID-19 Registry 多国 官方页未写
40 Disease Analyzer 德国 官方页未写
41 DrugEHRQA: A Question Answering Dataset on Structured and Unstructured Electronic Health Records For Medicine Related Queries 取自 MIMIC 或 eICU 英语
42 Early Prediction of Sepsis from Clinical Data: The PhysioNet/Computing in Cardiology Challenge 2019 美国 无自由文本
43 EchoNotes Structured Database derived from MIMIC-III 美国 英语
44 EHR-ReasonCon: Reasoning-Intensive Consistency Verification Between Clinical Notes and Structured Tables in Electronic Health Records 取自 MIMIC 或 eICU 官方页未写
45 EHRNoteQA: An LLM Benchmark for Real-World Clinical Practice Using Discharge Summaries 美国 官方页未写
46 EHRSHOT 美国 无自由文本
47 EHRSQL 无真实人群 英语
48 EHRXQA: A Multi-Modal Question Answering Dataset for Electronic Health Records with Chest X-ray Images 取自 MIMIC 或 eICU 英语
49 eICU Collaborative Research Database v2.0 美国 英语
50 emrQA: A Large Corpus for Question Answering on Electronic Medical Records 美国 英语
51 Epic Cosmos 美国 官方页未写
52 ER-REASON: A Benchmark Dataset for LLM-Based Clinical Reasoning in the Emergency Room 美国 官方页未写
53 Establishment of a Chinese critical care database from electronic healthcare records in a tertiary care medical center v1.0 中国 含中文
54 FDA Adverse Event Monitoring System (AEMS) 非个体记录 官方页未写
55 FinnGen 芬兰 官方页未写
56 Flatiron Health EHR-derived US data 美国 官方页未写
57 Framingham Heart Study 美国 官方页未写
58 GEMINI 加拿大 官方页未写
59 GePaRD 德国 官方页未写
60 GOSSIS-1-eICU, the eICU-CRD subset of the Global Open Source Severity of Illness Score (GOSSIS-1) dataset v1.0.0 美国 无自由文本
61 Health and Retirement Study(HRS) 美国 其他语种或多语种
62 Health Data Nexus 加拿大 官方页未写
63 Healthcare Map 美国 官方页未写
64 HiRID, a high time-resolution ICU dataset v1.1.1 瑞士 无自由文本
65 Hospital Authority Data Sharing Portal 中国香港 官方页未写
66 I-SPY 2 Breast Dynamic Contrast Enhanced MRI Trial(ISPY2) 未写明 官方页未写
67 ICES Data Repository 加拿大 官方页未写
68 Immunosuppressive Condition and Medication Annotations for Admission Notes in the MIMIC-III Database 美国 官方页未写
69 In-hospital physical activity measured with a new Bosch accelerometer sensor system 德国 官方页未写
70 INSPIRE, a publicly available research dataset for perioperative medicine v1.4.2 韩国 无自由文本
71 Insulin4RL: Real-Time Insulin Infusions For Offline Reinforcement Learning 美国 无自由文本
72 ISARIC COVID-19 dataset 多国 其他语种或多语种
73 ISLES 2022: A multi-center magnetic resonance imaging stroke lesion segmentation dataset 多国 无自由文本
74 JMDC Claims Database 日本 官方页未写
75 Landspatientregisteret 丹麦 官方页未写
76 MarketScan Research Databases 未写明 官方页未写
77 Maternal fat ultrasound measurement and nutritional assessment during pregnancy: A dataset centered in gestational outcomes 巴西 官方页未写
78 MDV Medical Database 日本 官方页未写
79 MedAgentBench 美国 英语
80 MedDec 美国 官方页未写
81 Medical Expenditure Panel Survey(MEPS) 美国 官方页未写
82 Medical Information Mart for Intensive Care Brazil (MIMIC-BR): a Brazilian Dataset of Anonymized Hospital and ICU Clinical Data v1.0.1 巴西 无自由文本
83 MeDiSumQA: Patient-Oriented Question-Answer Generation from Discharge Letters 取自 MIMIC 或 eICU 英语
84 MedNLI - A Natural Language Inference Dataset For The Clinical Domain v1.0.0 美国 英语
85 MedSecId 美国 英语
86 MedSynth 无真实人群 英语
87 MENDS 非个体记录 无自由文本
88 MICCAI 2020 RibFrac Challenge: Rib Fracture Detection and Classification 未写明 无自由文本
89 Million Veteran Program(MVP) 美国 官方页未写
90 MIMIC-CXR-Ext-MIMIC-CXR-DB 取自 MIMIC 或 eICU 官方页未写
91 MIMIC-Ext-SynNotes 无真实人群 英语
92 MIMIC-Eye: Integrating MIMIC Datasets with REFLACX and Eye Gaze for Multimodal Deep Learning Applications 美国 官方页未写
93 MIMIC-III and eICU-CRD: Feature Representation by FIDDLE Preprocessing 取自 MIMIC 或 eICU 无自由文本
94 MIMIC-III Clinical Database Demo v1.4 美国 无自由文本
95 MIMIC-III Clinical Database v1.4 美国 官方页未写
96 MIMIC-III Waveform Database Matched Subset v1.0 美国 无自由文本
97 MIMIC-III Waveform Database v1.0 美国 无自由文本
98 MIMIC-III-Ext-MIMIC-Patient v1.0.0 美国 英语
99 MIMIC-IV v3.1 美国 官方页未写
100 MIMIC-IV Waveform Database v0.1.0 美国 无自由文本
101 MIMIC-IV-ED v2.2 美国 官方页未写
102 MIMIC-IV-Ext Cardiac Disease v1.0.0 取自 MIMIC 或 eICU 官方页未写
103 MIMIC-IV-Ext Triage Instruction Corpus(MIETIC) 无真实人群 官方页未写
104 MIMIC-IV-Ext-BHC v1.2.0 美国 官方页未写
105 MIMIC-IV-Ext-ECG-Glucose v1.0.0 美国 无自由文本
106 MIMIC-IV-Ext-GPT-3_5-Generated-Discharge-Summaries-for-Low-Resource-Codes 无真实人群 官方页未写
107 MIMICEL v2.1.0 美国 官方页未写
108 MIT Critical Datathon 2023: a MIMIC-IV Derived Dataset for Pulse Oximetry Correction Models v1.0.0 美国 官方页未写
109 MOVER: Medical Informatics Operating Room Vitals and Events Repository 美国 官方页未写
110 MTS-Dialog 无真实人群 英语
111 Multimodal Clinical Monitoring in the Emergency Department (MC-MED) v1.0.1 美国 英语
112 MyCode Community Health Initiative 美国 官方页未写
113 NACC Uniform Data Set 美国 官方页未写
114 National Cancer Database(NCDB) 美国 官方页未写
115 National Clinical Cohort Collaborative (N3C) 美国 官方页未写
116 National Health Information Database(NHID) 韩国 官方页未写
117 National Inpatient Sample(NIS) 美国 官方页未写
118 National Institutes of Health Stroke Scale (NIHSS) Annotations for the MIMIC-III Database v1.0.0 取自 MIMIC 或 eICU 英语
119 National Lung Screening Trial(NLST) 美国 官方页未写
120 National Patient Register(Patientregistret) 瑞典 官方页未写
121 National Sleep Research Resource(NSRR) 美国 官方页未写
122 Nationwide Emergency Department Sample(NEDS) 美国 无自由文本
123 NCH Sleep DataBank: A Large Collection of Real-world Pediatric Sleep Studies with Longitudinal Clinical Data 美国 官方页未写
124 Northwestern ICU (NWICU) database v0.1.0 美国 官方页未写
125 Nosocomial Risk Datasets from MIMIC-III v1.0 取自 MIMIC 或 eICU 无自由文本
126 OECD 卫生统计 非个体记录 无自由文本
127 OHHR – The Oldenburg Hearing Health Record v1.5.0.0 德国 官方页未写
128 Open Access Dataset and Toolbox of High-Density Surface Electromyogram Recordings(Hyser) 未写明 无自由文本
129 openFDA 非个体记录 官方页未写
130 OpenSAFELY 英国 无自由文本
131 Osteoarthritis Initiative 美国 官方页未写
132 Osteoporotic Fractures in Men Study(MrOS) 美国 官方页未写
133 Our Future Health 英国 官方页未写
134 PAD-UFES-20 巴西 官方页未写
135 Paediatric Intensive Care database v1.1.0 中国 含中文
136 PCORnet® 美国 官方页未写
137 Phenotype Annotations for Patient Notes in the MIMIC-III Database 美国 英语
138 Predicting Mortality of ICU Patients: The PhysioNet/Computing in Cardiology Challenge 2012 取自 MIMIC 或 eICU 无自由文本
139 Predictors of Hospital Onset Infection: A Matched Retrospective Cohort Dataset 美国 无自由文本
140 Premier Healthcare Database(PHD) 美国 官方页未写
141 PriMock57 无真实人群 英语
142 PulseDB 多国 无自由文本
143 QResearch 英国 官方页未写
144 RadNLI: A natural language inference dataset for the radiology domain 取自 MIMIC 或 eICU 英语
145 RareBench 多国 英语
146 Reducing False Arrhythmia Alarms in the ICU: The PhysioNet/Computing in Cardiology Challenge 2015 v1.0.0 多国 无自由文本
147 Salzburg Intensive Care database (SICdb) v1.0.8 奥地利 官方页未写
148 SCIN Dataset 美国 无自由文本
149 SEER-Medicare Linked Data Resource 美国 无自由文本
150 Sex differences in age-related hearing loss v1.0.0 韩国 无自由文本
151 SimSUM 无真实人群 英语
152 Sleep Heart Health Study 美国 官方页未写
153 SNOMED CT to ICD-10-CM Map 非个体记录 官方页未写
154 Supportive Periodontal Therapy Clinical Examination Data 瑞士 无自由文本
155 Surveillance, Epidemiology, and End Results (SEER) Program 美国 无自由文本
156 Survey of Health, Ageing and Retirement in Europe(SHARE) 多国 官方页未写
157 Symile-MIMIC: a multimodal clinical dataset of chest X-rays, electrocardiograms, and blood labs from MIMIC-IV v1.0.0 取自 MIMIC 或 eICU 无自由文本
158 Synthea™ Patient Generator 无真实人群 官方页未写
159 Synthetic Acute Hypotension and Sepsis Datasets Based on MIMIC-III and Published as Part of the Health Gym Project v1.0.0 无真实人群 无自由文本
160 Système National des Données de Santé(SNDS) 法国 无自由文本
161 TCM-SD 中国 含中文
162 TCMEval-SDT 未写明 官方页未写
163 Term-Preterm EHG DataSet with Tocogram(TPEHGT DS) 斯洛文尼亚 无自由文本
164 The ADHD-200 Sample 多国 无自由文本
165 The National Longitudinal Study of Adolescent to Adult Health(Add Health) 美国 官方页未写
166 The Religious Orders Study and Memory and Aging Project(ROSMAP) 美国 官方页未写
167 TherLid: A Thermometry Linked Dataset 美国 官方页未写
168 THIN 多国 官方页未写
169 Towards Foundation Models for Critical Care Time Series 多国 无自由文本
170 TREC 2021 Clinical Trials Track 无真实人群 英语
171 TREC Precision Medicine Track 无真实人群 英语
172 TrialBench: Multi-Modal AI-Ready Datasets for Clinical Trial Prediction 非个体记录 官方页未写
173 TriNetX Global Real-World Data Network 多国 官方页未写
174 Truveta Data 美国 官方页未写
175 TWOSIDES 非个体记录 无自由文本
176 UCDP Georeferenced Event Dataset (GED) Global version 26.1 非个体记录 官方页未写
177 UK Biobank 英国 官方页未写
178 World Bank Open Data 非个体记录 无自由文本
179 中国健康与养老追踪调查(CHARLS) 中国 官方页未写
180 广安门医院慢性胃炎高质量数据集 中国 官方页未写

审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队|统计日期:2026-10-25