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MIMIC-CXR 胸片临床关联数据库(MIMIC-CXR-DB)
原名:MIMIC-CXR-Ext-MIMIC-CXR-DB。
概述
这份数据库由突尼斯斯法克斯大学等多国研究者构建,托管于 PhysioNet。它把 MIMIC-CXR-JPG 胸片与 MIMIC-IV v3.1 的住院、人口学、诊断和检验记录关联起来。构建时共纳入 377,095 张胸片、227,827 次影像检查,其中 146,333 张能落入住院时段并与住院关联。数据还含从放射报告与出院小结中抽取、并链接到本体的概念三元组,不含影像本身。
胸片判读需要结合患者的诊断、检验与住院经过。这份数据把胸片元数据、CheXpert 发现标签与同次住院的临床信息放在一起。它可用于研究影像发现与检验、诊断及院内死亡之间的关系。同一患者的多次检查与住院,也可用于纵向病程分析。
对人工智能学习的帮助
它派生自 MIMIC 的真实住院与胸片记录,属于 1.0 临床真实一层。模型可以学习胸片发现与同期检验、诊断之间的对应,以及报告文字中的临床概念。概念三元组由自动抽取与自动筛选得到,医生只审阅了表结构与类别映射,没有逐条复核。胸片发现标签沿用 CheXpert 自动标签,数据也未见给定的划分与评测规则。只有 38.8% 的胸片能关联住院,关联子集与全部 MIMIC-CXR 人群可能有差异。
记录形态
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 规模 | 377,095 张胸片,其中 146,333 张关联到住院 |
| 记录来源 | 诊疗过程 |
| 记录单位 | 患者、住院与影像检查 |
| 时间轴 | 纵向,同一患者可有多次影像检查与住院 |
| 结局 | 院内死亡时间与出院去向,无随访 |
| 专家标注 | 无,仅自动标签 |
| 任务环境 | 未列明 |
数据结构
表:radiographs.csv。
| 字段 | 含义 | 类型或取值 |
|---|---|---|
study_id |
影像检查标识 | 检查级主键 |
dicom_id |
单张图像标识 | 图像级主键 |
hadm_id |
关联的住院标识 | 未能关联住院时为空 |
study_datetime |
影像检查日期时间 | 日期时间 |
ViewPosition |
X 线投照体位 | 如 PA、AP、LATERAL |
Cardiomegaly |
是否提及心脏增大 | 1.0 阳性;0.0 阴性;-1.0 不确定;null 未提及 |
Pleural_Effusion |
是否提及胸腔积液 | 1.0 阳性;0.0 阴性;-1.0 不确定;null 未提及 |
No_Finding |
未见异常 | 1.0 阳性;0.0 阴性;-1.0 不确定;null 未提及 |
样例
表:radiographs.csv。
合成样例,非真实记录。
| 影像检查编号 | 图像编号 | 住院编号 | 投照体位 | 心脏增大 | 胸腔积液 | 未见异常 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1-1 | 101 | PA | 1.0 | -1.0 | null |
| 1 | 1-2 | 101 | LATERAL | 1.0 | -1.0 | null |
| 2 | 2-1 | — | AP | null | null | 1.0 |
获取
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 许可 | PhysioNet Credentialed Health Data License 1.5.0 |
| 商用 | 未列明 |
| 申请 | 须通过凭证审核、完成 CITI 培训并签数据使用协议 |
| 中国可用性 | 未写国别或机构限制,须凭证与 CITI 培训,不得共享数据 |
质量与局限
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 维护方口径 | 检验项目选取与概念类别映射经医生审阅。自动筛选保留 3,268 个放射键与 12,155 个出院小结键 |
| 已知局限 | 未逐条人工核对抽取的三元组。胸片与住院未能完全匹配,关联子集不能反映全部人群。不适用于临床决策 |
所属话题
- 检验、影像与病理判读 › 胸部影像与放射报告
出处
https://physionet.org/content/mimic-cxr-ext-mimic-cxr-db/1.0/;https://physionet.org/about/faqs/;https://physionet.org/content/mimic-cxr-ext-mimic-cxr-db/view-license/1.0/。
审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队