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英国生物样本库(UK Biobank)
原名:UK Biobank。
概述
英国生物样本库在 2006—2010 年招募了 501,938 名参加者,在英格兰、苏格兰与威尔士的评估中心完成基线评估。基线内容有触屏问卷、体格测量与生物样本。此后数据不断扩充,包括 MRI、DXA 与眼部 OCT 影像,基因组与 Olink 蛋白组,以及死亡、住院、癌症登记与全科记录的链接。全科初级保健链接数据覆盖约 45% 的队列。
它把基因、生活方式、影像与长期诊疗结局放在同一批人身上。研究者常用它分析常见慢性病的危险因素与遗传基础。链接的住院、癌症与死亡记录可追踪参加者多年后的发病与死亡。算法定义结局综合了自报、住院、死亡与全科记录,可直接用作研究终点。
对人工智能学习的帮助
它是研究队列与链接诊疗记录的结合,属于 1.0 临床真实一层。链接数据另有 OMOP 版本,能学到 2.0 规则语义。模型可以从中学到同一个人的基线特征与之后多年发病之间的联系。算法定义结局由多源记录自动派生,没有专家判定。链接数据近期部分可能不完整,英格兰 2020—21 年住院数据有重复版本。苏格兰住院数据暂不含产科,2017 年起威尔士癌症登记数据缺失。
记录形态
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 规模 | 501,938 名参加者 |
| 记录来源 | 研究方案采集、诊疗过程 |
| 记录单位 | 参加者个体 |
| 时间轴 | 纵向,2006—2010 年基线评估,随后链接全国死亡、住院与全科记录 |
| 结局 | 链接死亡登记、住院、癌症登记与全科记录,随访年限未列明 |
| 专家标注 | 无,仅自动标签 |
| 任务环境 | 未列明,另提供合成数据集供系统测试 |
数据结构
表:Showcase Category 100094:Baseline characteristics。
| 字段 | 含义 | 类型或取值 |
|---|---|---|
21022 Age at recruitment |
招募时年龄 | Integer,years |
34 Year of birth |
出生年份 | Integer,years |
52 Month of birth |
出生月份 | Categorical (single),Data-Coding 8 |
31 Sex |
性别,登记来源可经本人更新 | Categorical (single):0=Female,1=Male |
22189 Townsend deprivation index at recruitment |
招募时 Townsend 贫困指数 | Continuous |
样例
表:Showcase 类目 100094:Baseline characteristics。
合成样例,非真实记录。
| 招募时年龄 | 出生年份 | 出生月份 | 性别 | 招募时 Townsend 贫困指数 |
|---|---|---|---|---|
| 58 | 1950 | 3 | 0 | -2.14 |
| 64 | 1944 | 11 | 1 | 1.35 |
| 46 | 1962 | 7 | 0 | -4.10 |
获取
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 许可 | Material Transfer Agreement |
| 申请 | 经访问管理系统申请,按三档授权付费,主要在线访问 |
质量与局限
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 维护方口径 | 提供外部数据匹配算法与验证清洗文档。按统一规则估算各类链接数据截尾日期 |
| 已知局限 | 链接数据不按截尾日期截断,近期数据可能不完整。英格兰 2020–21 年住院数据有重复版本。2017 年起威尔士癌症登记数据缺失 |
所属话题
- 特殊话题 › 人群队列与生物样本库
出处
https://biobank.ndph.ox.ac.uk/showcase/;https://biobank.ndph.ox.ac.uk/showcase/exinfo.cgi?src=AccessingData;https://biobank.ndph.ox.ac.uk/showcase/exinfo.cgi?src=baseline_data;https://biobank.ndph.ox.ac.uk/showcase/exinfo.cgi?src=Data_providers_and_dates;https://biobank.ndph.ox.ac.uk/showcase/field.cgi?id=31;https://uk-biobank.gitbook.io/data-access-guide/readme/methods-of-accessing-uk-biobank-data;https://uk-biobank.gitbook.io/data-access-guide/readme/tiered-access。
审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队