尿路感染抗菌药物耐药数据集（AMR-UTI）

AMR-UTI 由麻省理工学院、卡内基梅隆大学与哈佛医学院的研究者发布，托管在 PhysioNet。数据来自麻省总医院和布莱根妇女医院 2007—2016 年收治的逾 80,000 名尿路感染患者，每条观测为一份尿标本。每份标本附呋喃妥因、复方磺胺甲噁唑、环丙沙星和左氧氟沙星的耐药结果。训练集为 2007—2013 年的 55,078 名患者，测试集为 2014—2016 年的 26,807 名患者。

尿路感染常要在药敏结果出来之前经验用药。这份数据可用于研究按患者特征预测耐药，并据此选择经验用药。单纯性尿路感染队列还记录了医生实际开出的经验用药，可与模型推荐的用药比较。

数据来自真实就诊的药敏结果与用药记录，属于 1.0 临床真实一层。模型可以从中学习既往耐药、用药和就诊特征与当前耐药之间的关系。耐药标签按 2017 年 CLSI 折点由检验结果换算，中介并入耐药，没有专家标注。数据按年份给定训练与测试集，可检验模型随时间推移的稳定性。二元特征中的 0 同时包含未观测和缺失，处方信息只覆盖单纯性队列。

项目	内容
规模	逾 80,000 名尿路感染患者，训练集 55,078 名、测试集 26,807 名
记录语言	无自由文本
记录来源	诊疗过程
记录单位	一份尿标本
时间轴	单次，标本以随机编号标识，不含日期时间
结局	无结局字段，药敏表型作为不同用药反事实结局的替代
专家标注	无，仅自动标签
任务环境	有，按年份固定划分训练集与测试集，未给评测指标

表：all_uti_resist_labels.csv。

字段	含义	类型或取值
example_id	标本唯一编号，用于跨文件链接	编号
NIT	是否对呋喃妥因耐药	二元，1＝耐药；无检测则为空
SXT	是否对复方磺胺甲噁唑耐药	二元，1＝耐药；无检测则为空
CIP	是否对环丙沙星耐药	二元，1＝耐药；无检测则为空
LVX	是否对左氧氟沙星耐药	二元，1＝耐药；无检测则为空
is_train	是否属于训练集	标记；训练集为 2007–2013 年
uncomplicated	是否属于单纯性尿路感染队列	标记

表：all_uti_resist_labels.csv。

合成样例，非真实记录。

标本编号	呋喃妥因耐药	复方磺胺甲噁唑耐药	环丙沙星耐药	左氧氟沙星耐药	训练集标记	单纯性尿路感染
1	0	1	0	0	1	1
2	0	0	1	1	1	0
3	1	0	—	—	0	0

项目	内容
许可	PhysioNet Credentialed Health Data License 1.5.0
商用	未列明
申请	须为 PhysioNet 凭证用户、完成 CITI 培训并签数据使用协议
中国可用性	须为 PhysioNet 认证用户、完成 CITI 培训并签协议，未列明地域限制

项目	内容
维护方口径	药敏结果按 2017 年 CLSI 折点转为敏感、中介、耐药。14 天内同部位重复标本去重，特征窗口排除近期记录
已知局限	二元特征中 0 同时表示未观测到与数据缺失。处方信息只给单纯性尿路感染队列

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https://physionet.org/content/antimicrobial-resistance-uti/1.0.0/；https://clinicalml.org/data/amr-dataset/；https://physionet.org/content/antimicrobial-resistance-uti/view-license/1.0.0/。