TREC 2021 临床试验检索赛道数据

原名:TREC 2021 Clinical Trials Track。

发布时间
2021
数据集规模
ClinicalTrials.gov 2021-04-27 快照,分 5 个压缩包
更新日期
2026-10-25
所属话题
特殊话题 › 临床试验数据

概述

这套数据来自美国国家标准与技术研究院(NIST)主办的 TREC 2021 临床试验赛道。文档集是 ClinicalTrials.gov 在 2021-04-27 的快照,以 XML 格式分 5 个压缩包发布。查询主题是受过医学训练者编写的合成病例,形式为一段入院记录。相关性判定由俄勒冈健康与科学大学医学信息学系完成,分为符合、被排除与不相关三档。

多数临床试验招募不到预定数量的受试者。这份数据把患者与试验的匹配写成检索问题。它可用于评价系统能否按入选与排除标准,为患者找到合适的试验。三档判定把“信息不足”与“明确被排除”分开,便于分析系统在排除标准上的错误。

对人工智能学习的帮助

主题病例由医学人员编写,相关性由受过医学信息学训练的医生逐条判定,能学到 3.0 专家判断。赛道按标准 TREC 检索流程评测,以 NDCG 计分并发布判定文件,能学到 4.0 任务环境。模型可以学习对照病例描述与试验的入选、排除标准,判断患者是否符合入组条件。主题都是合成病例,只有自由文本,不含结构化病历数据。赛道没有训练划分,数据许可条款未列明。

记录形态

项目 内容
规模 ClinicalTrials.gov 2021-04-27 快照,分 5 个压缩包
记录语言 英语
记录来源 合成数据、其他来源
记录单位 合成病例与试验登记文本
时间轴 不适用,无真实个体记录
结局 不适用,无真实个体记录
专家标注 有,受过医学信息学训练的医生逐条判定相关性
任务环境 有,NDCG 判分与官方 qrels,未设训练划分

样例

表:qrels2021.txt。

合成样例,非真实记录。

主题编号 固定常量 试验登记号 判定(0 不相关、1 被排除、2 符合)
1 0 — 2
2 0 — 1
3 0 — 0

获取

项目 内容
商用 未列明
申请 公开下载

质量与局限

项目 内容
维护方口径 汇集结果由受过医学信息学训练的医生判定为符合、排除或不相关。以 NDCG 评测
已知局限 主题只含病历自由文本描述,不含结构化 EHR 数据

所属话题

出处

https://trec.nist.gov/data/trials2021.html;https://trec-cds.org/2021.html。

审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队