BioVU 生物样本库与 Synthetic Derivative 去标识病历库

BioVU 是范德堡大学医学中心的 DNA 生物样本库，样本取自常规检测后剩余的血液，2007 年 2 月采集首批样本。样本以加密的研究编号与 Synthetic Derivative 关联。Synthetic Derivative 是该中心电子病历的去标识副本，含过去 20 年的临床信息并持续更新。截至 2023 年 1 月，BioVU 有 300,000 余份 DNA 样本，Synthetic Derivative 约有 350 万份个体记录。

研究者可按账单码、操作码、检验结果和笔记全文圈定病例与对照。随后调取对应的 DNA 做基因分型。它可用于全基因组关联研究、表型组关联研究和药物基因组学研究。病历覆盖住院与门诊，可研究基因型与长期诊疗记录之间的关联。

它是一家医学中心的纵向电子病历去标识副本，属于 1.0 临床真实一层。病历带账单编码与操作编码，能学到 2.0 规则语义。模型可以从中学习结构化编码与病史、出院小结等文本之间的对应，以及基因型与表型的关联。病例与对照队列借助自然语言处理生成，未见专家标注层。数据只来自范德堡一家机构，结局字段与随访年限未列明。外部研究者须有范德堡研究者参与，并先签合同。

项目	内容
规模	300,000 余份 DNA 样本，SD 约 350 万份个体记录
记录来源	诊疗过程
记录单位	患者个体
时间轴	纵向，电子病历去标识化镜像，覆盖住院与门诊并持续更新
专家标注	未列明
任务环境	无

项目	内容
许可	BioVU／SD 数据使用协议
商用	是，须另签协议，商业机构须联系 Nashville Biosciences
申请	须为 Vanderbilt 教员或有其 PI 合作，经 IRB 与科学审查委员会批准并签协议
中国可用性	外部研究者须有 Vanderbilt PI 参与并先签合同，未列明国别条件

项目	内容
维护方口径	样本接收含人工与自动排除。启动时以 26,724 份记录的示范项目评估表型丰富度
已知局限	样本来自常规检测剩余血液。资源主要面向 Vanderbilt 研究者

• 特殊话题　›　人群队列与生物样本库

https://www.vumc.org/dbmi/node/144；https://victr.vumc.org/biovu-description/；https://victr.vumc.org/how-to-use-biovu/；https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3763939/。