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MIMIC-Ext-SynNotes 合成临床笔记语料
原名:MIMIC-Ext-SynNotes。
概述
这份语料由澳大利亚联邦科学与工业研究组织(CSIRO)和美国国立医学图书馆的作者整理,托管于 PhysioNet。作者用 5 个开放权重大模型,逐份或逐块改写 MIMIC-III 与 MIMIC-IV-Note 的临床笔记。源笔记去重后有 464 万份,约 14 亿词。发布内容为 8 个合成语料,每行保留源库、原笔记编号与笔记类别。
公开的临床文本规模有限,难以满足语言模型训练的需要。这份语料可用于临床语言模型的继续预训练与领域适配。每份合成笔记都能按编号对回原笔记,可用于研究大模型改写时保留和改动了哪些临床信息。
对人工智能学习的帮助
它是大模型改写的合成文本,不属于 1.0 至 4.0 中的任何一层。它的用处在于扩充临床文本的语料量,供模型熟悉病历的用语与文体。人工错误分析发现,改写文本会遗漏内容、误解语境,出现时间与数值错误和虚构细节。文中像真实日期、姓名的字串都是生成伪迹。数据没有结局、专家标注和评测任务,不能作为临床事实来源。
记录形态
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 规模 | 8 个合成语料,源自 464 万份去重笔记 |
| 记录语言 | 英语 |
| 记录来源 | 合成数据 |
| 记录单位 | 一份笔记或其分块 |
| 时间轴 | 单次,每行为一份源笔记或分块的改写文本 |
| 结局 | 无结局字段 |
| 专家标注 | 无,文本由 5 个开放权重大语言模型改写生成 |
| 任务环境 | 未列明 |
数据结构
表:data/synthetic-chunks-by-Llama.csv。
| 字段 | 含义 | 类型或取值 |
|---|---|---|
source |
源数据库 | mimic_iii_1.4 或 mimic_iv_2.2 |
note_id |
原笔记编号,同一笔记的各分块重复 | MIMIC-III 为 ROW_ID,MIMIC-IV 为 note_id |
category |
MIMIC 笔记类别 | 如 Discharge summary、Nursing、Radiology |
chunk_id |
分块在原笔记中的位置,仅分块级文件有 | 整数,从 0 起 |
text |
大模型生成的合成文本 | 文本 |
样例
表:data/synthetic-chunks-by-Llama.csv。
合成样例,非真实记录。
| 源数据库 | 原笔记编号 | 笔记类别 | 分块序号 |
|---|---|---|---|
| mimic_iii_1.4 | 58213 | Discharge summary | 0 |
| mimic_iii_1.4 | 58213 | Discharge summary | 1 |
| mimic_iii_1.4 | 61477 | Nursing | 0 |
获取
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 许可 | PhysioNet Credentialed Health Data License 1.5.0 |
| 商用 | 未列明 |
| 申请 | 须通过凭证审核、完成 CITI 培训并签数据使用协议 |
| 中国可用性 | 未写国别或机构限制,仍受凭证访问约束 |
质量与局限
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 维护方口径 | 发布前删除空生成与非英语输出。配套研究评价后称核心临床信息与粗粒度任务效用得以保留 |
| 已知局限 | 合成文本在长度、句式与词汇分布上与原文可测地不同。人工错误分析发现遗漏、时间与数值错误及幻觉。不得作临床事实来源或用于临床决策 |
所属话题
- 特殊话题 › 合成数据
出处
https://physionet.org/content/mimic-ext-synnotes/1.0/;https://physionet.org/about/faqs/;https://physionet.org/content/mimic-ext-synnotes/view-license/1.0/。
审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队