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AIPatient 患者知识图谱(AIPatient KG)
原名:AIPatient KG v1.0.0。
概述
AIPatient KG 是密歇根大学作者团队在 PhysioNet 上发布的患者知识图谱。它从 MIMIC-III 分层抽取 56 名患者的 56 次住院,另建 40 名肿瘤患者的 CORAL 图谱,乳腺癌、胰腺癌各 20 名。图谱节点包括症状、病史、过敏、社会史、家族史与生命体征。数据另附问答集,MIMIC-III 部分 524 题,CORAL 部分 423 题。
知识图谱把病历里的症状、病史和检查结果整理成相互连接的实体。这份数据可用于研究病历信息的结构化抽取与核验方法。它也可用于搭建模拟病人对话系统。问答集可用于检验系统能否从病历中答出具体事实。
对人工智能学习的帮助
它的实体来自真实出院小结与结构化表,属于 1.0 临床真实一层。两名医学专家独立核验并合并了自动抽取的实体。问答题由三名医生拟定,答案由另一名医生独立复核,模型能学到 3.0 专家判断。样本只有 56 名与 40 名患者,只涉及重症与肿瘤,泛化有限。问答集没有固定划分与评测脚本。访问须 PhysioNet 认证并签数据使用协议。
记录形态
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 规模 | MIMIC-III 部分 56 名患者、CORAL 部分 40 名肿瘤患者,问答 524 题与 423 题 |
| 记录语言 | 英语 |
| 记录来源 | 诊疗过程 |
| 记录单位 | 患者知识图谱 |
| 时间轴 | 单次,每名 MIMIC-III 患者对应 1 次住院 |
| 结局 | 住院时长与出院去向,无随访 |
| 专家标注 | 有,两名医学专家审定实体,三名医生拟定问答题 |
| 任务环境 | 未列明,问答集带参考答案但无固定划分与评测脚本 |
数据结构
表:Patient 节点(AIPatient KG)。
| 字段 | 含义 | 类型或取值 |
|---|---|---|
SUBJECT_ID |
患者编号 | 节点属性;未列明类型 |
GENDER |
性别 | 节点属性;未列明取值表 |
AGE |
年龄 | 节点属性;未列明类型 |
ETHNICITY |
种族/族裔 | 节点属性;未列明取值表 |
RELIGION |
宗教 | 节点属性;未列明取值表 |
MARITAL_STATUS |
婚姻状况 | 节点属性;未列明取值表 |
获取
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 许可 | PhysioNet Credentialed Health Data License 1.5.0 |
| 商用 | 未列明 |
| 申请 | 须通过凭证审核、完成 CITI 培训并签数据使用协议 |
质量与局限
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 维护方口径 | 实体经大语言模型抽取后由两名医学专家独立评估合并。问答答案取自病历,另由一名医生独立核对 |
| 已知局限 | 样本仅 56+40 名患者。仅涉及重症与肿瘤数据,泛化有限。排除未成年、分娩与无法交流等患者 |
所属话题
- 医疗工作流程 › 病历问答与推理
出处
https://physionet.org/content/aipatient-kg/1.0.0/;https://physionet.org/content/aipatient-kg/view-license/1.0.0/。
审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队