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单次住院结构化病历数据集(MIMIC-Patient)
原名:MIMIC-III-Ext-MIMIC-Patient v1.0.0。
概述
这份数据由宾夕法尼亚大学与南佛罗里达大学的研究者从 MIMIC-III 派生,托管在 PhysioNet。作者从 2,597 次合格住院中无放回随机抽取 500 次,每次住院整理成一个 JSON 文件。文件汇集人口学、入院信息、诊断、用药、操作、生命体征、检验,以及心电、超声心动图和放射报告。出院小结由大语言模型抽取为结构化字段,源库覆盖 2001—2012 年的重症监护住院。
临床问答常要从分散的检验、报告与病程文字里找答案。这份数据把一次住院的信息集中在一个文件里,可用于研究病历问答与信息检索的准确性。配套脚本 answer_agent.py 按关键词把问题导向对应字段,可作为对照流程。纳入的是存活出院、诊断少于五个的非新生儿住院,适合研究相对简单完整的病例。
对人工智能学习的帮助
它把真实重症住院记录整理为患者级结构,属于 1.0 临床真实一层。模型可以从中学习同一次住院内检验、用药、报告与诊断如何相互印证。出院小结的结构化由模型自动完成,规则解析与抽取可能有少量错误,也没有专家复核。数据只给记录,不含问答对、标准答案或评测规则。病例偏简单完整,又只来自一家医院,外推性有限。
记录形态
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 规模 | 500 次住院,每次住院一个 JSON 文件 |
| 记录语言 | 英语 |
| 记录来源 | 诊疗过程 |
| 记录单位 | 一次住院 |
| 时间轴 | 单次,每个文件对应一次住院,含带时间戳的检验与报告 |
| 结局 | 只纳入存活出院的住院,未设结局标签,无随访 |
| 专家标注 | 未列明,出院小结由大语言模型结构化 |
| 任务环境 | 未列明,只提供问答生成脚本 |
样例
表:patient_json/{id}.json。
合成样例,非真实记录。
| 入院诊断 | 医保类型 | 语言 | 族裔 | 首个诊断 ICD-9 编码 | 诊断简称 | 首项处方药物 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| pneumonia | medicare | engl | white | 486 | Pneumonia, organism NOS | Ceftriaxone |
| chest pain | private | engl | black/african american | 41401 | Crnry athrscl natve vssl | Aspirin |
| gi bleed | medicaid | span | hispanic or latino | 5789 | Gastrointest hemorr NOS | Pantoprazole |
获取
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 许可 | PhysioNet Credentialed Health Data License 1.5.0 |
| 商用 | 未列明 |
| 申请 | 须通过凭证审核、完成 CITI 培训并签数据使用协议 |
| 中国可用性 | 未写国别限制,不得把受控数据传给不符合协议的第三方大模型服务 |
质量与局限
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 维护方口径 | 说明纳入标准、抽样方式与三类数据的抽取方法。附范例 JSON 与问答脚本 |
| 已知局限 | 只选诊断少于五个且数据完整的住院,偏向简单病例。单中心 2001–2012 年数据,外推性有限。规则解析与大语言模型结构化可能有少量错误 |
所属话题
- 医疗工作流程 › 病历文本标注与抽取
出处
https://physionet.org/content/mimic-iii-ext-mimic-patient/1.0.0/;https://physionet.org/content/mimic-iii-ext-mimic-patient/view-license/1.0.0/。
审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队