临床试验预测多模态数据集(TrialBench)

原名:TrialBench: Multi-Modal AI-Ready Datasets for Clinical Trial Prediction。

发布时间
2024-06-30
数据集规模
8 类预测任务、23 个数据集
更新日期
2026-10-25
所属话题
特殊话题 › 临床试验数据

概述

TrialBench 由香港科技大学(广州)与南京大学等机构的研究者发布。它从 ClinicalTrials.gov 登记的临床试验整理出 8 类预测任务、23 个数据集,并入 DrugBank 等药物信息。记录以试验为单位,含试验设计、分期、干预、疾病 ICD-10 编码、申办方、入排标准、摘要与药物分子结构。数据不含受试者个体记录。按试验数计,试验时长任务有 143.8K 项,药物剂量任务有 12.8K 项。

它用于在临床试验设计阶段预测风险与结局。任务包括试验时长、受试者脱落、严重不良事件、死亡事件、能否获批与失败原因。数据还可用于入排标准设计与药物剂量推荐。

对人工智能学习的帮助

它汇总临床试验的登记文本与试验层面结果,不含患者个体记录。疾病按 ICD-10 编码,药物附 SMILES 分子结构,能学到 2.0 规则语义。维护方提供的加载函数直接给出训练、验证与测试集,并附评测指标与基线模型,能学到 4.0 任务环境。失败原因与剂量标签由大语言模型从登记文本自动转换,没有为研究另做的专家标注。部分试验缺完成日期与结局。涉及 DrugBank 与 TrialTrove 的部分只限学术或非商业使用。

记录形态

项目 内容
规模 8 类预测任务、23 个数据集
记录来源 其他来源
记录单位 临床试验
时间轴 不适用,以试验为单位,不含受试者个体记录
结局 不适用,预测目标为试验时长、脱落、严重不良事件、获批与失败原因
专家标注 无,仅自动标签,失败原因与剂量标签由大语言模型从登记文本转换
任务环境 有,加载函数返回训练、验证、测试集,并给评测指标与基线模型

数据结构

表:Serious Adverse Event Forecasting 特征集。

字段 含义 类型或取值
brief_title 试验题名 非结构化文本
brief_summary 试验摘要,2 至 5 句 textblock
condition 试验针对的疾病 非结构化文本
icdcode 疾病的 ICD-10 编码 如 G30.0
phase 试验分期 Phase I 至 IV
enrollment 实际或预期入组人数 数值
minimum_age 招募患者的最小年龄 数值
smiless 药物分子的 SMILES 字符串 字符串

样例

表:Serious Adverse Event Forecasting 特征集。

合成样例,非真实记录。

试验针对的疾病 疾病 ICD-10 编码 试验分期 入组人数 最小招募年龄
Alzheimer Disease G30.0 Phase II 240 50
Type 2 Diabetes E11.9 Phase III 1200 18
Breast Cancer C50.9 Phase I 36 18

获取

项目 内容
许可 数据集未单列许可,代码为 MIT License,论文为 CC BY-NC-ND 4.0
商用 是,须另签协议,DrugBank 与 TrialTrove 部分仅限非商业使用
申请 公开下载,经项目网站与程序包获取

质量与局限

项目 内容
维护方口径 每个任务设筛选条件,并给出基线与多模态深度学习实验结果。失败原因与剂量标签由大语言模型自动转换
已知局限 仍有重要任务与数据集未纳入。部分试验缺少完成日期与结局等特征

所属话题

出处

https://huyjj.github.io/Trialbench/;https://doi.org/10.1038/s41597-025-05680-8;https://github.com/ML2Health/ML2ClinicalTrials;https://www.nature.com/articles/s41597-025-05680-8/tables/3;https://raw.githubusercontent.com/ML2Health/ML2ClinicalTrials/main/README.md;https://raw.githubusercontent.com/ML2Health/ML2ClinicalTrials/main/LICENSE。

审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队