真实世界数据研究专区 · 数据集
临床试验预测多模态数据集(TrialBench)
原名:TrialBench: Multi-Modal AI-Ready Datasets for Clinical Trial Prediction。
概述
TrialBench 由香港科技大学(广州)与南京大学等机构的研究者发布。它从 ClinicalTrials.gov 登记的临床试验整理出 8 类预测任务、23 个数据集,并入 DrugBank 等药物信息。记录以试验为单位,含试验设计、分期、干预、疾病 ICD-10 编码、申办方、入排标准、摘要与药物分子结构。数据不含受试者个体记录。按试验数计,试验时长任务有 143.8K 项,药物剂量任务有 12.8K 项。
它用于在临床试验设计阶段预测风险与结局。任务包括试验时长、受试者脱落、严重不良事件、死亡事件、能否获批与失败原因。数据还可用于入排标准设计与药物剂量推荐。
对人工智能学习的帮助
它汇总临床试验的登记文本与试验层面结果,不含患者个体记录。疾病按 ICD-10 编码,药物附 SMILES 分子结构,能学到 2.0 规则语义。维护方提供的加载函数直接给出训练、验证与测试集,并附评测指标与基线模型,能学到 4.0 任务环境。失败原因与剂量标签由大语言模型从登记文本自动转换,没有为研究另做的专家标注。部分试验缺完成日期与结局。涉及 DrugBank 与 TrialTrove 的部分只限学术或非商业使用。
记录形态
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 规模 | 8 类预测任务、23 个数据集 |
| 记录来源 | 其他来源 |
| 记录单位 | 临床试验 |
| 时间轴 | 不适用,以试验为单位,不含受试者个体记录 |
| 结局 | 不适用,预测目标为试验时长、脱落、严重不良事件、获批与失败原因 |
| 专家标注 | 无,仅自动标签,失败原因与剂量标签由大语言模型从登记文本转换 |
| 任务环境 | 有,加载函数返回训练、验证、测试集,并给评测指标与基线模型 |
数据结构
表:Serious Adverse Event Forecasting 特征集。
| 字段 | 含义 | 类型或取值 |
|---|---|---|
brief_title |
试验题名 | 非结构化文本 |
brief_summary |
试验摘要,2 至 5 句 | textblock |
condition |
试验针对的疾病 | 非结构化文本 |
icdcode |
疾病的 ICD-10 编码 | 如 G30.0 |
phase |
试验分期 | Phase I 至 IV |
enrollment |
实际或预期入组人数 | 数值 |
minimum_age |
招募患者的最小年龄 | 数值 |
smiless |
药物分子的 SMILES 字符串 | 字符串 |
样例
表:Serious Adverse Event Forecasting 特征集。
合成样例,非真实记录。
| 试验针对的疾病 | 疾病 ICD-10 编码 | 试验分期 | 入组人数 | 最小招募年龄 |
|---|---|---|---|---|
| Alzheimer Disease | G30.0 | Phase II | 240 | 50 |
| Type 2 Diabetes | E11.9 | Phase III | 1200 | 18 |
| Breast Cancer | C50.9 | Phase I | 36 | 18 |
获取
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 许可 | 数据集未单列许可,代码为 MIT License,论文为 CC BY-NC-ND 4.0 |
| 商用 | 是,须另签协议,DrugBank 与 TrialTrove 部分仅限非商业使用 |
| 申请 | 公开下载,经项目网站与程序包获取 |
质量与局限
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 维护方口径 | 每个任务设筛选条件,并给出基线与多模态深度学习实验结果。失败原因与剂量标签由大语言模型自动转换 |
| 已知局限 | 仍有重要任务与数据集未纳入。部分试验缺少完成日期与结局等特征 |
所属话题
- 特殊话题 › 临床试验数据
出处
https://huyjj.github.io/Trialbench/;https://doi.org/10.1038/s41597-025-05680-8;https://github.com/ML2Health/ML2ClinicalTrials;https://www.nature.com/articles/s41597-025-05680-8/tables/3;https://raw.githubusercontent.com/ML2Health/ML2ClinicalTrials/main/README.md;https://raw.githubusercontent.com/ML2Health/ML2ClinicalTrials/main/LICENSE。
审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队