MIMIC-III 出院小结医疗决策标注数据集(MedDec)

原名:MedDec。

发布时间
2024-10-16
数据集规模
451 份出院小结、419 名患者,10 类决策
更新日期
2026-10-25
所属话题
医疗工作流程 › 病历文本标注与抽取

概述

这份数据由马萨诸塞大学洛厄尔分校与麻省理工学院的作者发布,托管在 PhysioNet。它对 MIMIC-III 中 451 份出院小结做了医疗决策片段标注,涉及 419 名患者、逾 54,000 个句子、约 140 万 token。决策按 DICTUM 分类体系分为 10 类,患者覆盖 11 种表型。发布内容只有标注,出院小结原文要另从 MIMIC-III 取得。

出院小结记下了住院期间的诊断、用药、检查与随访安排等决定。这份标注可用于研究医生决策在病历文本里如何表述、如何分布。它也可用于比较不同性别、种族和英语熟练程度患者的决策记录差异。数据按训练 350 份、验证 53 份、测试 48 份划分。

对人工智能学习的帮助

它取自真实出院小结,属于 1.0 临床真实一层。它也能学到 3.0 专家判断,两名受训医学生全量标注,分歧由一名医师裁决,Cohen's κ 为 0.74。模型可以从中学习在长篇病历里定位决策片段,并判断它属于哪一类决策。标注只到片段级,没有结局字段,模型学不到决策是否恰当。测试集未随首发版本发布,评测细则当时也未公布。

记录形态

项目 内容
规模 451 份出院小结、419 名患者,10 类决策
记录来源 诊疗过程
记录单位 一份出院小结
时间轴 纵向,部分患者有多次住院的出院小结
结局 无结局字段
专家标注 有,两名医学生全量标注,医学博士裁决分歧
任务环境 有,固定划分 350/53/48 份,测试集待共享任务后公开

数据结构

表:标注 JSON 文件(每份出院小结一个)。

字段 含义 类型或取值
annotator_id 标注者编号 编号
discharge_summary_id 出院小结唯一标识 [SUBJECT_ID][HADM_ID][ROW_ID]
annotations 标注片段列表 数组
start_offset 片段起始字符位置 字符索引
end_offset 片段结束字符位置 字符索引
category 医疗决策类别 DICTUM 分类中的 10 类之一
decision 标注片段的文本 文本
annotation_id 每条标注的唯一标识 编号

样例

表:标注 JSON 文件(每份出院小结一个)。

合成样例,非真实记录。

出院小结标识 标注者编号 标注编号 片段起点 片段终点 决策类别
1001_100001_20001 1 1 1180 1236 Drug
1001_100001_20001 1 2 1502 1571 Gathering information
1001_100001_20001 1 3 2210 2265 Contact related

获取

项目 内容
许可 PhysioNet Credentialed Health Data License 1.5.0
商用 未列明
申请 须通过凭证审核、完成 CITI 培训并签数据使用协议

质量与局限

项目 内容
维护方口径 依 DICTUM 分类体系全量人工标注,Cohen's Kappa=0.74。标注未使用任何自动方法
已知局限 测试集 48 份首发版本未含,待共享任务结束后公开。评测细则当时尚未公布

所属话题

出处

https://physionet.org/content/meddec/1.0.0/;https://physionet.org/content/meddec/view-license/1.0.0/。

审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队