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英格兰全科电子病历安全分析平台(OpenSAFELY)
原名:OpenSAFELY。
概述
OpenSAFELY 是代表 NHS England 运营的安全分析平台。牛津大学 Bennett 应用数据科学研究所、伦敦卫生与热带医学院与电子病历软件公司共同建立了它。平台覆盖 5,700 余万名患者的假名化 NHS 初级保健记录。记录为全科诊所的编码事件、用药、疫苗与登记信息,并链接急诊、住院、ONS 死亡登记与重症监护等数据。数据留在软件公司的数据中心内,研究者只能取回经审核的聚合结果。
平台为应对 COVID-19 而建,研究多为人群层面的感染风险因素、疫苗接种与治疗。全科记录覆盖 2009-01-01 起在 TPP 诊所登记过的患者,可研究慢性病管理与用药安全。链接住院与死亡登记后,可追踪全科诊疗之后的住院与死亡。
对人工智能学习的帮助
它是英格兰全科诊所的日常编码诊疗记录,属于 1.0 临床真实一层。诊断与用药使用 SNOMED CT、CTV3 与 dm+d 编码,能学到 2.0 规则语义。研究者看不到个体记录,模型只能在平台内以代码形式训练和评估。输出发布前要经统计披露控制与人工审核。数据不含自由文本,转诊详情不全,部分编码日期可能异常。平台目前暂停接收新项目申请。
记录形态
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 规模 | 5,700 余万名患者 |
| 记录语言 | 无自由文本 |
| 记录来源 | 诊疗过程 |
| 记录单位 | 患者 |
| 时间轴 | 纵向,经 NHS 号链接住院、急诊与死亡登记 |
| 结局 | 链接 ONS 死亡登记及住院、急诊记录,随访年限未写 |
| 专家标注 | 未列明 |
| 任务环境 | 未列明 |
数据结构
表:clinical_events(ehrQL tpp schema)。
| 字段 | 含义 | 类型或取值 |
|---|---|---|
date |
临床或就诊事件日期 | date |
snomedct_code |
事件的 SNOMED CT 编码 | SNOMED-CT code;与 ctv3_code 二者只填其一 |
ctv3_code |
事件的 CTV3(Read v3)编码 | CTV3 (Read v3) code |
numeric_value |
事件附带的数值 | float |
consultation_id |
关联就诊的编号 | integer |
样例
表:clinical_events(ehrQL TPP 后端)。
合成样例,非真实记录。
| 就诊编号 | SNOMED CT 编码 | 事件附带数值 |
|---|---|---|
| 50311 | 271649006 | 142 |
| 50311 | 27113001 | 81.5 |
| 50311 | 44054006 | — |
获取
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 商用 | 未列明 |
| 申请 | 每名成员须单独申请,由 Bennett Institute 与 NHS England 审核,目前暂停接收新申请 |
| 中国可用性 | 未写国别限制,研究者只能取回经审核的聚合结果 |
质量与局限
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 维护方口径 | 分析均以代码写成并存于 GitHub,操作日志尽量公开。提供虚拟数据,并逐项说明日期异常等数据问题 |
| 已知局限 | 不含自由文本,转诊详情不完整。部分编码事件日期可能无效或异常。部分链接数据仅限 COVID-19 研究 |
所属话题
- 特殊话题 › 初级保健记录
- 话题:慢性心力衰竭
- 话题:慢性阻塞性肺疾病
- 话题:2 型糖尿病并发症筛查与管理
- 话题:2 型糖尿病的降糖药物治疗
- 话题:晚期肿瘤的姑息治疗
- 话题:阿尔茨海默病
- 话题:帕金森病
出处
https://docs.opensafely.org/;https://docs.opensafely.org/data-sources/;https://docs.opensafely.org/data-sources/systmone/;https://docs.opensafely.org/data-access-policy/;https://docs.opensafely.org/five-safes/;https://www.opensafely.org/for-research/。
审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队