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胸片读片眼动与临床多模态整合数据集(MIMIC-Eye)
原名:MIMIC-Eye: Integrating MIMIC Datasets with REFLACX and Eye Gaze for Multimodal Deep Learning Applications。
概述
MIMIC-Eye 由昆士兰科技大学、里斯本高等理工学院和 INESC-ID 的研究者整合,托管在 PhysioNet。数据按患者整合 MIMIC-IV 住院与急诊记录、MIMIC-CXR 胸片与报告,以及 REFLACX 和 EyeGaze 两个读片眼动数据集。共收录 3,192 名患者、1,644 次急诊停留和 3,689 张胸片,其中 1,683 张胸片能连到临床数据。底层数据来自美国波士顿贝斯以色列女执事医疗中心 2011—2019 年。
放射科医生读片时会结合体温、心率等临床信息。这份数据可用于研究胸片与临床数据的联合建模。眼动轨迹和口述报告记下了医生看片的位置与顺序,可用于研究读片注意力与诊断之间的关系。
对人工智能学习的帮助
胸片和急诊、住院记录来自真实诊疗,属于 1.0 临床真实一层。REFLACX 部分有放射科医生的病灶框、眼动、语音与转录,能学到 3.0 专家判断。数据附带沿用 MIMIC-CXR-JPG 的划分文件,属于 4.0 任务环境,评测指标未列明。55.99% 的胸片在急诊时段内找不到对应停留,只有时间窗内的胸片能连到临床数据。EyeGaze 只有一名放射科医生,缺失与质量问题沿袭母库。
记录形态
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 规模 | 3,192 名患者、3,689 张胸片 |
| 记录来源 | 诊疗过程、研究方案采集 |
| 记录单位 | 患者 |
| 时间轴 | 纵向,同一患者可有多次住院与急诊停留,跨度 2011—2019 年 |
| 专家标注 | 有,沿用 REFLACX 与 EyeGaze 中放射科医生的病灶标注与眼动数据 |
| 任务环境 | 有,沿用母库的固定划分文件,未给评测指标或脚本 |
数据结构
表:ED/triage.csv。
| 字段 | 含义 | 类型或取值 |
|---|---|---|
temperature |
患者体温 | 华氏度 |
heartrate |
心率 | 次/分 |
resprate |
呼吸频率 | 次/分 |
o2sat |
外周血氧饱和度 | 百分比 |
sbp |
收缩压 | mmHg |
dbp |
舒张压 | mmHg |
pain |
患者自评疼痛程度 | 0–10 分 |
acuity |
分诊优先级 | 1–5 级,1 级最高 |
样例
表:ED/triage.csv。
合成样例,非真实记录。
| 体温(°F) | 心率(次/分) | 呼吸频率(次/分) | 血氧饱和度(%) | 收缩压(mmHg) | 舒张压(mmHg) | 疼痛评分(0—10) | 分诊级别(1—5) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 98.6 | 92 | 18 | 97 | 132 | 78 | 4 | 3 |
| 101.2 | 118 | 24 | 91 | 104 | 62 | 2 | 2 |
| 97.9 | 76 | 16 | 99 | 145 | 88 | 0 | 3 |
获取
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 许可 | PhysioNet Restricted Health Data License 1.5.0 |
| 商用 | 未列明 |
| 申请 | 注册 PhysioNet 并签数据使用协议 |
| 中国可用性 | 未写地域限制,不得与他人共享访问 |
质量与局限
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 维护方口径 | 按急诊停留时间窗匹配胸片与临床数据。修复 EyeGaze 中被截断的 DICOM_ID,整合代码开源 |
| 已知局限 | 仅做最小预处理,缺失与质量问题继承自母库。55.99% 的胸片在急诊时段内找不到 stay_id。EyeGaze 只有一名放射科医生 |
所属话题
- 检验、影像与病理判读 › 胸部影像与放射报告
出处
https://physionet.org/content/mimic-eye-multimodal-datasets/1.0.0/;https://physionet.org/content/mimic-eye-multimodal-datasets/view-license/1.0.0/。
审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队