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日本生物银行(BioBank Japan)
原名:BioBank Japan(BBJ)。
概述
日本生物银行由东京大学医科学研究所维护,是面向基因组研究的疾病导向型生物样本库。第一队列于 2003 年 6 月至 2008 年 3 月入组,第二队列于 2012 年 12 月至 2017 年 12 月入组。研究对象是日本各地合作医疗机构中确诊 51 种目标疾病的就诊患者。库内保存约 270,000 名患者的 DNA 与临床信息、约 200,000 名患者的血清,16,000 人有全基因组测序。
研究者可以用它做日本人群的疾病易感基因、药物反应与预后研究。第一队列对持续来院者继续采集血清与临床信息,平均随访逾 10 年,部分死因经死亡证明确定。样本与数据向学术机构与企业提供,须经审查、签材料转让协议并付费。
对人工智能学习的帮助
它记录了 51 种疾病患者的诊断、就诊信息与长期随访,属于 1.0 临床真实一层。模型可以学习日本人群基因型与疾病之间的关联,以及慢性病在十年尺度上的转归。研究对象全部是目标疾病患者,不能代表一般人群。除年龄、性别与一种疾病名外,可提供的临床信息条目有限。未见另做的专家标注,也没有统一的训练与测试划分。
记录形态
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 规模 | 约 270,000 名患者的 DNA 与临床信息、约 200,000 名患者的血清;登记病种中心力衰竭 12,890 例 |
| 记录来源 | 研究方案采集、诊疗过程 |
| 记录单位 | 患者 |
| 时间轴 | 纵向,平均随访逾 10 年,跨度 2003—2008 年与 2012—2017 年两批入组 |
| 结局 | 部分病例经死亡证明确定死因,平均随访逾 10 年 |
| 专家标注 | 未列明 |
| 任务环境 | 未列明 |
数据结构
表:第1コホート 提供臨床情報(【基本情報】基本情報)。
| 字段 | 含义 | 类型或取值 |
|---|---|---|
身長 |
身高,现症项 | 数値,cm |
体重 |
体重,现症项 | 数値,kg |
収縮期血圧 |
收缩压,现症项 | 数値,mmHg |
拡張期血圧 |
舒张压,现症项 | 数値,mmHg |
喫煙歴 |
吸烟史 | 単一選択:なし◆あり◆不明 |
飲酒歴 |
饮酒史 | 単一選択:なし◆あり◆不明 |
牛乳 |
饮食习惯中牛奶的摄入频率 | 単一選択:ほぼ毎日◆週3-4日◆週1-2日◆ほとんど食べない |
散歩 |
运动习惯中散步的频率与时长 | 単一選択:毎日30分以上 至 してない,共 7 档 |
样例
表:第一队列临床信息(基本信息)。
合成样例,非真实记录。
| 身高(cm) | 体重(kg) | 收缩压(mmHg) | 舒张压(mmHg) | 吸烟史 | 饮酒史 |
|---|---|---|---|---|---|
| 165.2 | 62.4 | 132 | 84 | あり | あり |
| 152.0 | 50.1 | 118 | 72 | なし | なし |
| 170.5 | 71.8 | 145 | 90 | 不明 | あり |
获取
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 许可 | BBJ 样本与数据使用审查指南及材料转让协议 |
| 商用 | 是,须另签协议,企业按全价付费 |
| 申请 | 须本单位伦理批准、经 BBJ 审查委员会审查、签材料转让协议并付费 |
质量与局限
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 维护方口径 | 取得 ISO 9001:2015 与 ISO/IEC 27001:2013 认证。SNP 芯片分型检出率≥99% 者占 98.70% |
| 已知局限 | 仅收 51 种目标疾病的医院就诊患者,非一般人群。可提供的临床信息条目有限 |
所属话题
出处
https://biobankjp.org/en/;https://biobankjp.org/en/researchers/1971;https://biobankjp.org/en/researchers/1974;https://biobankjp.org/en/researchers/2013;https://biobankjp.org/en/researchers/2019;https://biobankjp.org/en/researchers/2016。
审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队