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ER-REASON 急诊临床推理基准数据集
原名:ER-REASON: A Benchmark Dataset for LLM-Based Clinical Reasoning in the Emergency Room。
概述
这份数据由 AlaaLab 团队整理,托管于 PhysioNet,采集与去标识由加州大学旧金山分校 Information Commons 完成。它收录美国一家大型学术医疗中心 2022 年 3 月至 2024 年 3 月入急诊的成年患者。规模为 3,437 名患者、3,984 次就诊、25,174 篇临床文书。每次就诊附同一机构既往的出院小结、病程记录、影像报告等历史文书。
急诊医生要在信息零散、时间紧迫的条件下完成分诊、评估、处置和去向决定。这份数据按这几个环节组织,可用于研究急诊决策与既往病史之间的关系。它带有急诊去向和最终诊断的 ICD-10 编码,可用于研究诊断与收治决策。
对人工智能学习的帮助
它属于 1.0 临床真实一层,文书来自真实急诊与既往就诊,诊断用 ICD-10 编码、分诊用 ESI 分级,能学到 2.0 规则语义。72 份医生推理说明,以及两名急诊医生对 194 例评测病例的共识评分,属于 3.0 专家判断。模型能从中学习急诊医生先排除危重诊断、再定处置的推理顺序。五项基准任务各有输入、输出与评价指标,属于 4.0 任务环境,数据划分未列明。数据只来自单一学术医疗中心,没有出院后随访,部分年份字段用 1970 表示缺失。
记录形态
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 规模 | 3,437 名患者、3,984 次就诊、25,174 篇临床文书 |
| 记录来源 | 诊疗过程 |
| 记录单位 | 一次急诊就诊 |
| 时间轴 | 纵向,每次急诊就诊附同一机构既往就诊的历史文书,跨度 2022—2024 年 |
| 结局 | 急诊去向与最终诊断编码,无出院后随访 |
| 专家标注 | 有,急诊医师撰写 72 份推理说明,194 例评测病例由两名急诊医生标注 |
| 任务环境 | 有,五项基准任务各给输入、输出与评价指标 |
数据结构
表:er_reason.csv。
| 字段 | 含义 | 类型或取值 |
|---|---|---|
primarychiefcomplaintname |
来急诊时的主诉 | 标准化主诉 |
primaryeddiagnosisname |
本次急诊结束时的诊断 | 文本 |
acuitylevel |
分诊时的 ESI 分级 | Emergency Severity Index |
eddisposition |
离开急诊时的去向 | 如 discharged、admitted、transferred |
ED_Provider_Notes_Text |
本次急诊的医生记录全文 | 自由文本 |
One_Sentence_Extracted |
从急诊医生记录抽取的一句话摘要 | 文本 |
Rule_Out |
医生据主诉等列出的鉴别诊断 | 专家撰写文本 |
Treatment_Plan |
医生选择的处置与治疗计划 | 专家撰写文本 |
样例
表:er_reason.csv。
合成样例,非真实记录。
| 年龄 | 到达急诊年份 | 分诊 ESI 分级 | 离开急诊时的去向 |
|---|---|---|---|
| 64 | 2023 | 2 | admitted |
| 29 | 2022 | 4 | discharged |
| 77 | 2024 | 3 | transferred |
获取
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 许可 | PhysioNet Contributor Review Health Data License 1.5.0 |
| 商用 | 未列明 |
| 申请 | 须为 PhysioNet 认证用户、完成 CITI 培训并签协议,每项研究经数据提供方审核 |
| 中国可用性 | 须认证、培训、签协议并经提供方审核,未列明国别限制 |
质量与局限
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 维护方口径 | 每项任务写明输入、输出与评价指标。推理评测以医生共识分作为参考答案 |
| 已知局限 | 仅供研究,不可用于临床决策。部分年份字段以 1970 表示缺失。单一学术医疗中心 |
所属话题
- 急危重症 › 急诊
出处
https://physionet.org/content/er-reason/1.0.0/;https://github.com/AlaaLab/ER-Reason;https://raw.githubusercontent.com/AlaaLab/ER-Reason/main/README.md;https://physionet.org/content/er-reason/view-license/1.0.0/。
审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队