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新冠共享学习数据库(CDSL)
原名:COVID Data for Shared Learning (CDSL)。
概述
这份数据库来自西班牙私立医院集团 HM Hospitales,收录 4,479 名确诊或疑似新冠住院患者的电子病历与放射影像。收治时间为 2019-12-26 至 2021-02-13。结构化表含生命体征 224,146 条、用药 115,649 条、检验 786,984 条。影像共 1,444,764 张,其中 X 线 4,608 张、CT 1,440,156 张,属于 1,859 名患者。
这份数据在新冠流行初期就向国际研究者开放。它覆盖急诊、住院与 ICU 各个环节。研究者可以用它分析入院时的生命体征和检验,与转入 ICU、机械通气、出院去向之间的关系。胸片与 CT 能和同一患者的检验、用药对照,可用于影像与临床指标的联合分析。
对人工智能学习的帮助
它是一家医院集团新冠住院患者的真实诊疗记录,属于 1.0 临床真实一层。诊断按 ICD-10 编码,用药附 ATC 分类,能学到 2.0 规则语义。模型可以从中学习急诊、住院到 ICU 的诊疗顺序,以及检验、用药与影像之间的对应。数据没有为研究另做的专家标注,也没有给定的划分与评测规则。新冠在当时的 ICD-10 中没有专用编码,部分字段为西班牙语,不同患者之间的日期也不能比较。
记录形态
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 规模 | 4,479 名住院患者,影像 1,444,764 张 |
| 记录语言 | 部分字段为西班牙语 |
| 记录来源 | 诊疗过程 |
| 记录单位 | 患者与住院 |
| 时间轴 | 单次,每名患者一次新冠相关住院 |
| 结局 | 出院去向与 ICU 天数等住院期间信息,无随访 |
| 专家标注 | 无 |
| 任务环境 | 无 |
数据结构
表:lab_06.csv。
| 字段 | 含义 | 类型或取值 |
|---|---|---|
lab_number |
检验申请号 | 以 I 开头为住院,以 U 开头为急诊 |
lab_date |
送检申请日期 | 日期 |
time_lab |
送检申请时间 | 时间;仅急诊记录 |
item_lab |
检验项目 | 文本 |
val_result |
检验结果数值 | numerical |
result_text |
检验结果文字 | free text |
ud_result |
结果计量单位 | 文本 |
ref_values |
结果解读用的参考范围 | 文本 |
样例
表:CDSL-1.0.0-dicom-metadata.csv。
合成样例,非真实记录。
| 患者编号 | 检查编号 | 图像编号 | 影像类型 | X 线投照体位 | CT 扫描体位 | 空间分辨率 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 10484178 | s15410429 | 15410429_0001 | DX | PA | Unknown | 0.148 |
| 10484178 | s45095325 | 45095325_0001 | CT | Unknown | HFS | Unknown |
| 47285296 | s10370535 | 10370535_0001 | CR | AP | Unknown | 0.125 |
获取
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 许可 | PhysioNet Contributor Review Health Data License 1.5.0 |
| 商用 | 未列明 |
| 申请 | 须 PhysioNet 认证、CITI 培训、签数据使用协议并经贡献方逐项审核 |
| 中国可用性 | 未写国别限制,须经贡献方逐项审核 |
质量与局限
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 维护方口径 | 尽量保留原始数据,只做最少转换。附表结构、字段说明与编码字典,转换代码开源 |
| 已知局限 | 新冠在当时的 ICD-10 版本中无编码。日期平移后不同患者之间无时间可比性。影像为有损压缩 JPG,只覆盖 1,859 名患者 |
所属话题
- 感染性疾病 › 新型冠状病毒感染
出处
https://physionet.org/content/covid-data-shared-learning/1.0.0/;https://physionet.org/content/covid-data-shared-learning/view-license/1.0.0/。
审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队