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临床药物基因组学实施联盟(CPIC)数据库
原名:CPIC Data。
概述
CPIC 数据库由临床药物基因组学实施联盟维护,把经同行评审的基因与药物指南整理成结构化条目。条目包括等位基因功能、二倍型与表型对应、给药建议和决策支持提示语。库里还有按人群汇总的等位基因频率,不含个体记录。2026-02-06 的统计快照显示,库内有 573 个基因与药物配对、31 部指南、24 张表共 500,418 行。
医生开具某些药物前,可按患者的药物代谢基因型调整药物或剂量。这份数据库把指南中的给药建议做成可查询的表,可用于电子病历中的临床决策支持提示。按人群汇总的等位基因频率,可用于估计不同人群中需要调整用药的比例。
对人工智能学习的帮助
它是药物基因组学知识库,不含个体诊疗记录。它能学到 3.0 专家判断,每条推荐都来自专家共识指南,并标有推荐分级。模型可以从中学习基因型、代谢表型与给药建议之间的对应规则,用作用药推荐的知识约束。内容随指南更新,没有固定发布周期,训练时要记下所用版本。数据不含患者结局,模型学不到建议在真实患者中的效果。
记录形态
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 规模 | 573 个基因药物对、31 部指南、500,418 行数据 |
| 记录语言 | 英语 |
| 记录来源 | 其他来源 |
| 记录单位 | 知识库条目 |
| 时间轴 | 不适用,基因药物指南条目与人群级等位基因频率 |
| 结局 | 不适用,无个体记录 |
| 专家标注 | 有,工作人员把循证指南整理为结构化条目 |
| 任务环境 | 无 |
数据结构
表:recommendation。
| 字段 | 含义 | 类型或取值 |
|---|---|---|
id |
自动分配的数字主键 | integer |
guidelineid |
所属指南,外键指向 guideline.id | integer |
drugid |
推荐所针对的药物,外键指向 drug.drugid | character varying |
phenotypes |
适用表型,按基因映射 | jsonb |
activityscore |
适用活性评分,按基因映射 | jsonb |
drugrecommendation |
给药或治疗建议 | text |
classification |
推荐分级,定义见指南补充材料 | character varying |
population |
推荐适用人群 | text |
样例
表:recommendation。
| 推荐编号 | 指南编号 | 药物编号 | 适用表型 | 给药建议 | 推荐分级 | 适用人群 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 8480385 | 100411 | RxNorm:32968 | {"CYP2C19": "Normal Metabolizer"} | If considering clopidogrel, use at standard dose (75 mg/day) | Strong | CVI ACS PCI |
| 8480387 | 100411 | RxNorm:32968 | {"CYP2C19": "Intermediate Metabolizer"} | Avoid standard dose (75 mg) clopidogrel if possible. Use prasugrel or ticagrelor at standard dose if no contraindication. | Strong | CVI ACS PCI |
| 8480389 | 100411 | RxNorm:32968 | {"CYP2C19": "Poor Metabolizer"} | Avoid clopidogrel if possible. Use prasugrel or ticagrelor at standard dose if no contraindication. | Strong | CVI ACS PCI |
获取
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 商用 | 未列明 |
| 申请 | 公开下载,REST API 公开可查 |
质量与局限
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 维护方口径 | 内容来自经同行评审的循证基因药物指南。指南发表后随即发布新版 |
| 已知局限 | 内容随指南更新而变化,无固定发布周期 |
所属话题
- 临床药理 › 药物基因组学
出处
https://api.cpicpgx.org/v1/;https://github.com/cpicpgx/cpic-data/wiki;https://api.cpicpgx.org/v1/statistic?createdon=eq.2026-02-06T09:42:04.702;https://cpicpgx.org/;https://api.cpicpgx.org/v1/guideline?select=id;https://www.clinpgx.org/page/dataUsagePolicy/;https://raw.githubusercontent.com/wiki/cpicpgx/cpic-data/Home.md。
审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队