临床药物基因组学实施联盟(CPIC)数据库

原名:CPIC Data。

发布时间
2020-05-17
数据集规模
573 个基因药物对、31 部指南、500,418 行数据
更新日期
2026-10-25
所属话题
临床药理 › 药物基因组学

概述

CPIC 数据库由临床药物基因组学实施联盟维护,把经同行评审的基因与药物指南整理成结构化条目。条目包括等位基因功能、二倍型与表型对应、给药建议和决策支持提示语。库里还有按人群汇总的等位基因频率,不含个体记录。2026-02-06 的统计快照显示,库内有 573 个基因与药物配对、31 部指南、24 张表共 500,418 行。

医生开具某些药物前,可按患者的药物代谢基因型调整药物或剂量。这份数据库把指南中的给药建议做成可查询的表,可用于电子病历中的临床决策支持提示。按人群汇总的等位基因频率,可用于估计不同人群中需要调整用药的比例。

对人工智能学习的帮助

它是药物基因组学知识库,不含个体诊疗记录。它能学到 3.0 专家判断,每条推荐都来自专家共识指南,并标有推荐分级。模型可以从中学习基因型、代谢表型与给药建议之间的对应规则,用作用药推荐的知识约束。内容随指南更新,没有固定发布周期,训练时要记下所用版本。数据不含患者结局,模型学不到建议在真实患者中的效果。

记录形态

项目 内容
规模 573 个基因药物对、31 部指南、500,418 行数据
记录语言 英语
记录来源 其他来源
记录单位 知识库条目
时间轴 不适用,基因药物指南条目与人群级等位基因频率
结局 不适用,无个体记录
专家标注 有,工作人员把循证指南整理为结构化条目
任务环境 无

数据结构

表:recommendation。

字段 含义 类型或取值
id 自动分配的数字主键 integer
guidelineid 所属指南,外键指向 guideline.id integer
drugid 推荐所针对的药物,外键指向 drug.drugid character varying
phenotypes 适用表型,按基因映射 jsonb
activityscore 适用活性评分,按基因映射 jsonb
drugrecommendation 给药或治疗建议 text
classification 推荐分级,定义见指南补充材料 character varying
population 推荐适用人群 text

样例

表:recommendation。

推荐编号 指南编号 药物编号 适用表型 给药建议 推荐分级 适用人群
8480385 100411 RxNorm:32968 {"CYP2C19": "Normal Metabolizer"} If considering clopidogrel, use at standard dose (75 mg/day) Strong CVI ACS PCI
8480387 100411 RxNorm:32968 {"CYP2C19": "Intermediate Metabolizer"} Avoid standard dose (75 mg) clopidogrel if possible. Use prasugrel or ticagrelor at standard dose if no contraindication. Strong CVI ACS PCI
8480389 100411 RxNorm:32968 {"CYP2C19": "Poor Metabolizer"} Avoid clopidogrel if possible. Use prasugrel or ticagrelor at standard dose if no contraindication. Strong CVI ACS PCI

获取

项目 内容
商用 未列明
申请 公开下载,REST API 公开可查

质量与局限

项目 内容
维护方口径 内容来自经同行评审的循证基因药物指南。指南发表后随即发布新版
已知局限 内容随指南更新而变化,无固定发布周期

所属话题

出处

https://api.cpicpgx.org/v1/;https://github.com/cpicpgx/cpic-data/wiki;https://api.cpicpgx.org/v1/statistic?createdon=eq.2026-02-06T09:42:04.702;https://cpicpgx.org/;https://api.cpicpgx.org/v1/guideline?select=id;https://www.clinpgx.org/page/dataUsagePolicy/;https://raw.githubusercontent.com/wiki/cpicpgx/cpic-data/Home.md。

审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队