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缺血性卒中病灶分割挑战数据集(ISLES 2022)
原名:ISLES 2022: A multi-center magnetic resonance imaging stroke lesion segmentation dataset。
概述
ISLES 2022 是缺血性卒中病灶分割挑战的公开数据集,由挑战组织方整理。数据取自德国与瑞士三家卒中中心的临床常规 MRI,共 400 例多厂商检查。每例含 DWI、ADC、FLAIR 三种序列,以及专家勾画的梗死病灶掩膜。训练集 250 例公开下载,测试集 150 例只用于模型验证。
急性缺血性卒中的梗死范围,是评估病情与制定治疗方案的参考之一。这份数据可用于研究 DWI、ADC、FLAIR 上梗死灶的自动勾画与体积测量。它也可用于比较分割方法在不同中心、不同厂商设备之间的稳定性。挑战按 Dice、体积差、病灶计数差与病灶级 F1 逐例排名,各方法的结果可以横向对照。
对人工智能学习的帮助
它是带逐例专家勾画的多中心卒中 MRI,属于 1.0 临床真实一层。模型能从中学到 3.0 专家判断。每例标注先由算法预分割,再经医学生修改、住院医师复核,最后由资深神经放射科医师终审。固定划分、隐藏测试集和逐例判分规则,属于 4.0 任务环境。数据只有影像与掩膜,没有临床变量与结局,不能用于预后建模。测试集含训练阶段未见的中心与再通治疗前影像,泛化表现可能下降。
记录形态
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 规模 | 400 例 MRI,训练集 250 例、测试集 150 例 |
| 记录语言 | 无自由文本 |
| 记录来源 | 诊疗过程 |
| 记录单位 | 一次 MRI 检查 |
| 时间轴 | 单次,每例为一次急性至亚急性期卒中 MRI 检查 |
| 结局 | 无结局字段 |
| 专家标注 | 有,医学生修改预分割,神经放射科医师复核与终审 |
| 任务环境 | 有,训练 250 例、隐藏测试 150 例,提供评测脚本与排行榜 |
数据结构
表:单个病例目录(BIDS:rawdata 与 derivatives)。
| 字段 | 含义 | 类型或取值 |
|---|---|---|
sub-strokecase0009_ses-0001_dwi.nii.gz |
弥散加权成像(DWI)图像 | NIfTI 图像,位于 rawdata |
sub-strokecase0009_ses-0001_adc.nii.gz |
表观弥散系数(ADC)图 | NIfTI 图像,位于 rawdata |
sub-strokecase0009_ses-0001_flair.nii.gz |
FLAIR 序列图像 | NIfTI 图像,位于 rawdata |
sub-strokecase0009_ses-0001_adc.json |
对应图像的扫描参数元数据 | JSON,来自 DICOM 头,有则提供 |
sub-strokecase0009_ses-0001_msk.nii.gz |
专家标注的梗死病灶掩膜(金标准) | NIfTI 掩膜,位于 derivatives |
sub-strokecase0009_ses-0001_snp.png |
病例快照图 | PNG,位于 derivatives |
样例
表:ISLES-2022.zip 中 sub-strokecase0056 三个序列的 JSON 头信息。
| 文件 | 设备厂商 | 设备型号 | 场强(T) | 采集方式 | 层厚(mm) | 重复时间(ms) | 回波时间(ms) | 扩散 b 值 | 图像行数 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| sub-strokecase0056_ses-0001_dwi.json | Philips Medical Systems | Achieva dStream | 3.0 | 2D | 2.0 | 5000.00048828125 | 78.0 | 1000.0 | 112 |
| sub-strokecase0056_ses-0001_adc.json | Philips Medical Systems | Achieva dStream | 3.0 | 2D | 2.0 | 5000.00048828125 | 78.0 | 0.0 | 112 |
| sub-strokecase0056_ses-0001_FLAIR.json | Philips Medical Systems | Achieva dStream | 3.0 | 3D | 1.0 | 4800.0 | 272.739 | 0.0 | 352 |
获取
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 许可 | CC BY 4.0 |
| 商用 | 是 |
| 申请 | 公开下载,测试集不公开 |
质量与局限
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 维护方口径 | 预分割后经医学生、住院医师修改复核,主治医师终审。另对 10 例做评分者间一致性实验 |
| 已知局限 | 真值只与人工标注者水平相当。仅排除严重运动伪影病例。测试集含未见中心,泛化表现可能下降 |
所属话题
出处
https://doi.org/10.5281/zenodo.7153326;https://doi.org/10.5281/zenodo.17736412;https://doi.org/10.1038/s41597-022-01875-5;https://isles22.grand-challenge.org/。
审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队