真实世界数据研究专区 · 数据集
Synthea 合成患者生成器
原名:Synthea™ Patient Generator。
概述
Synthea 是 MITRE 公司主持、开源社区共同开发的合成患者生成器,按疾病模块从出生开始模拟每名患者的病史。输出的病历含用药、过敏、就诊、检验、操作、照护计划和社会决定因素,格式有 HL7 FHIR、C-CDA、CSV 和 CPCDS。生成器可以产生大量合成患者,网站另提供逾一千名样例患者下载。默认人口学参数取自马萨诸塞州人口普查。
合成病历不涉及真实患者,可在没有隐私限制的条件下开发和测试医疗信息系统。研究者也用它检验数据管线、FHIR 接口和分析代码。疾病模块依据 CDC、NIH 等统计设定,可在合成人群中模拟政策变化的影响。
对人工智能学习的帮助
就诊与诊断用 SNOMED CT 编码,用药用 RxNorm 编码,病历按 FHIR 等标准组织,能学到 2.0 规则语义。模型可以从中学习病历的标准结构,以及各类编码在一份病历中如何互相关联。病程由模块规则生成,不含真实诊疗中的变异、差错与缺失。疾病模块参考临床人员意见制定,部分模块仍在等待临床专家评审。默认人口参数基于马萨诸塞州,用于其他人群要调整参数。
记录形态
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 规模 | 生成器可产生几乎无限的合成患者,官网提供逾一千名样例患者 |
| 记录来源 | 合成数据 |
| 记录单位 | 合成患者 |
| 时间轴 | 纵向,每名合成患者从出生模拟至今 |
| 结局 | 模拟的生命周期结局,非真实结局,无真实随访 |
| 专家标注 | 无 |
| 任务环境 | 无 |
数据结构
表:encounters.csv。
| 字段 | 含义 | 类型或取值 |
|---|---|---|
Id |
就诊记录主键 | UUID |
Start |
就诊开始日期时间 | iso8601 UTC Date(yyyy-MM-dd'T'HH:mm'Z') |
Stop |
就诊结束日期时间 | iso8601 UTC Date,可空 |
Patient |
关联患者的外键 | UUID |
EncounterClass |
就诊类别 | String:ambulatory、emergency、inpatient、wellness、urgentcare 等 |
Code |
就诊编码 | String,SNOMED-CT |
Total_Claim_Cost |
含全部明细项的就诊总费用 | Numeric |
ReasonCode |
就诊针对的诊断编码 | String,SNOMED-CT,可空 |
样例
表:csv/medications.csv(synthea_sample_data_csv_apr2020.zip)。
合成样例,非真实记录。
| 合成患者编号 | 药品编码(RxNorm) | 药品名称 | 单次费用 | 支付方承担 | 配药次数 | 总费用 | 用药原因编码(SNOMED CT) | 用药原因 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8d4c4326-e9de-4f45-9a4c-f8c36bff89ae | 389221 | Etonogestrel 68 MG Drug Implant | 677.08 | 0.00 | 12 | 8124.96 | — | — |
| 10339b10-3cd1-4ac3-ac13-ec26728cb592 | 313782 | Acetaminophen 325 MG Oral Tablet | 8.14 | 0.00 | 1 | 8.14 | 10509002 | Acute bronchitis (disorder) |
| 1d604da9-9a81-4ba9-80c2-de3375d59b40 | 562251 | Amoxicillin 250 MG / Clavulanate 125 MG Oral Tablet | 11.91 | 0.00 | 1 | 11.91 | 444814009 | Viral sinusitis (disorder) |
获取
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 许可 | Apache License, Version 2.0 |
| 商用 | 是 |
| 申请 | 公开下载 |
| 中国可用性 | 开源,未列明地域限制 |
质量与局限
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 维护方口径 | 疾病模块由临床人员参与,并依据 CDC、NIH 等真实世界统计设定 |
| 已知局限 | 均为合成数据,非真实患者。默认人口参数基于马萨诸塞州。部分模块未经临床专家评审 |
所属话题
- 特殊话题 › 合成数据
出处
https://synthetichealth.github.io/synthea/;https://raw.githubusercontent.com/synthetichealth/synthea/master/README.md;https://raw.githubusercontent.com/synthetichealth/synthea/master/LICENSE。
审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队