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重症监护时间序列多中心协调数据集
原名:Towards Foundation Models for Critical Care Time Series。
概述
这份数据由苏黎世联邦理工学院计算机系等团队整理,随 2024 年的论文发布。它把 MIMIC-III、MIMIC-IV、eICU、AmsterdamUMCdb、HiRID、SICdb、PICdb、Zigong EHR 和 MIMIC-IV-ED 的数据协调到同一套变量。处理后的住院与就诊超过 600,000 次,数据点接近 10 亿。数据按 5 分钟与 60 分钟网格导出,涵盖生命体征、检验、治疗与给药速率和静态信息。
各家 ICU 数据库的变量名、单位与采样频率不同,跨库研究要先做协调。这份数据可用于研究预测模型在不同医院之间的迁移。它给出循环衰竭、呼吸衰竭、肾功能、失代偿与急诊去向的预测任务,可用于比较早期预警模型。
对人工智能学习的帮助
它属于 1.0 临床真实一层,来源都是真实的 ICU 与急诊记录,覆盖美国、荷兰、瑞士、中国等地。论文给出多中心同分布、留一中心迁移和微调三种评测设置,报 AUROC 与 AUPRC,属于 4.0 任务环境。模型能从中学习跨医院通用的重症时间序列表示。任务标签由临床定义自动计算,没有专家标注。协调后数据的获取方式与许可未列明,任务也只限在线早期事件预测。
记录形态
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 规模 | 超过 600,000 次住院或就诊,数据点接近 10 亿 |
| 记录语言 | 无自由文本 |
| 记录来源 | 诊疗过程 |
| 记录单位 | ICU 入住或急诊就诊 |
| 时间轴 | 单次,以单次 ICU 入住或急诊就诊为单位的时间序列 |
| 结局 | 循环衰竭、呼吸衰竭与失代偿等预测标签及急诊去向,无随访 |
| 专家标注 | 无,仅自动标签 |
| 任务环境 | 有,三种评测设置,报 AUROC 与 AUPRC,划分是否发布未写 |
数据结构
表:Table 8: Concept reference。
| 字段 | 含义 | 类型或取值 |
|---|---|---|
age |
年龄 | demographic,years |
sex |
性别 | demographic,categorical |
hr |
心率 | observation,bpm |
map |
平均动脉压 | observation,mmHg |
lact |
乳酸 | observation,mmol/L |
crea |
肌酐 | observation,mg/dL |
urine_rate |
每小时尿量 | observation,mL/h |
norepi |
去甲肾上腺素给药 | treatment,mcg/min |
获取
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 商用 | 未列明 |
质量与局限
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 维护方口径 | 跨库做概念协调,治疗变量依临床专家意见定义。去除离群值、插补并标准化 |
| 已知局限 | 只考虑在线早期事件预测任务。未纳入需付费签约的 RICD。不同医院数据存在明显分布差异 |
所属话题
- 急危重症 › 重症派生数据与预测基准
出处
https://arxiv.org/abs/2411.16346;https://arxiv.org/html/2411.16346。
审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队