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MIMIC-III 院内获得性疾病风险数据集
原名:Nosocomial Risk Datasets from MIMIC-III v1.0。
概述
数据集由美国国家医学图书馆的作者从 MIMIC-III 派生,用于三种院内获得性疾病的风险预测。三种疾病是急性肾损伤、压力性损伤与贫血,各有训练、验证与测试队列。病历文本被转换为 UMLS 概念编号,按日汇总成每次住院的概念序列。病例数未列明。
院内获得性急性肾损伤、压力性损伤和贫血会延长住院、增加费用。这份数据可用于研究入院 48 小时后这三类事件的提前预警。它也可用于比较基于病历文本的不同风险预测方法。
对人工智能学习的帮助
它的输入来自真实病历文本,属于 1.0 临床真实一层。病历被映射为 UMLS 标准概念,模型能学到 2.0 规则语义。标签按 KDIGO、NPUAP 与 WHO 标准等规则自动判定,没有人工判定。阴性样本的事件日期是抽样生成的,不对应真实事件。预测提前量的表述前后不一,有 24—96 小时与 48—96 小时两种。
记录形态
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 记录语言 | 无自由文本 |
| 记录来源 | 诊疗过程 |
| 记录单位 | 一次住院 |
| 时间轴 | 单次,按日汇总单次住院中各份病历的概念快照 |
| 结局 | 院内获得性急性肾损伤、压力性损伤与贫血的事件日期 |
| 专家标注 | 无,仅自动标签 |
| 任务环境 | 有,三种疾病各有固定划分,评测指标未写 |
数据结构
表:chronology CSV files。
| 字段 | 含义 | 类型或取值 |
|---|---|---|
subject_id |
患者编号 | CSV 第 1 列 |
hadm_id |
住院编号 | CSV 第 2 列 |
timestamp |
该组观测的记录时间(chart time) | CSV 第 3 列 |
observations |
病历中抽取的观测概念 | 以空格分隔的观测 ID 列表,如 UMLS CUI |
样例
表:chronology CSV。
合成样例,非真实记录。
| 患者编号 | 住院编号 | 当日抽取的 UMLS 概念 |
|---|---|---|
| 10001 | 100001 | C0020538 C0011849 C0018802 |
| 10001 | 100001 | C0020538 C0018802 C0032285 |
| 10001 | 100001 | C0018802 C0032285 C0002871 |
获取
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 许可 | PhysioNet Credentialed Health Data License 1.5.0 |
| 商用 | 未列明 |
| 申请 | 须通过凭证审核、完成 CITI 培训并签数据使用协议 |
| 中国可用性 | 未写国别限制,个人须过凭证审核 |
质量与局限
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 维护方口径 | 事件日期按种子概念、词汇模式与结构化标准判定。阴性样本以 Gamma 分布抽取伪事件时间 |
| 已知局限 | 标签为规则间接监督,非人工判定。阴性样本事件日期为抽样生成。预测提前量页面前后不一 |
所属话题
出处
https://physionet.org/content/nosocomialriskdata/1.0/;https://physionet.org/content/nosocomialriskdata/view-license/1.0/。
审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队