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MIMIC-III 波形数据库匹配子集
原名:MIMIC-III Waveform Database Matched Subset v1.0。
概述
匹配子集取自 MIMIC-III 波形数据库,收录能可靠对应到 MIMIC-III 临床库患者的记录。它有 22,317 条波形记录、22,247 条数值记录,涉及 10,282 名 ICU 患者。两类记录分别约占全库的 34% 与 35%。记录以 MIMIC-III 的患者编号命名,日期按临床库规则平移。
监护信号与临床库对上之后,可以和诊断、用药、检验与结局放在一起分析。这份数据可用于研究生命体征变化与临床事件、住院结局之间的关系。临床信息须另行申请 MIMIC-III 临床库获取。
对人工智能学习的帮助
它是同一患者多段 ICU 监护记录,属于 1.0 临床真实一层。与临床库链接后,模型可以学习生理信号与诊疗记录之间的对应。子集本身不含结局,也没有专家标注。监护仪未直连病历系统,只有约三分之一的记录能可靠匹配,匹配上的人群可能有偏。波形起止时间与入出 ICU 时间不一定一致,记录只能定位到病区,不能定位到床位。
记录形态
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 规模 | 22,317 条波形记录、22,247 条数值记录、10,282 名 ICU 患者 |
| 记录语言 | 无自由文本 |
| 记录来源 | 诊疗过程 |
| 记录单位 | 波形与数值记录 |
| 时间轴 | 纵向,同一患者可有多段波形与数值记录,日期已平移 |
| 结局 | 无结局字段,须另行申请 MIMIC-III 临床库 |
| 专家标注 | 无 |
| 任务环境 | 无 |
数据结构
表:matched 主头文件(pXXNNNN-YYYY-MM-DD-hh-mm.hea)。
| 字段 | 含义 | 类型或取值 |
|---|---|---|
record name |
记录名,含匹配的 MIMIC-III Subject_ID 与起始时间 | pXXNNNN-YYYY-MM-DD-hh-mm;年月日为替代日期 |
number of segments |
多段记录的段数 | 整数,跟在记录名后的“/”之后 |
number of signals |
记录内信号路数 | 非负整数;波形最多 8 路同步 |
sampling frequency |
每路信号每秒采样数 | 浮点数;波形记录为 125 |
number of samples per signal |
每路信号的样本数 | 整数 |
base time |
记录起始的时刻 | HH:MM:SS |
base date |
记录起始日期,与临床库替代日期一致 | DD/MM/YYYY |
样例
表:p044083 号患者数值记录 3314767n(每秒 1 个样本)。
| 距记录起点秒数 | 心率(次/分) | 脉率(次/分) | 有创收缩压(mmHg) | 有创舒张压(mmHg) | 有创平均压(mmHg) | 呼吸频率(次/分) | 血氧饱和度(%) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 600 | 85 | 缺测 | 129 | 65 | 85 | 10 | 缺测 |
| 3600 | 92 | 93 | 145 | 79 | 99 | 19 | 97 |
| 7200 | 92 | 91 | 133 | 63 | 85 | 15 | 100 |
获取
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 许可 | Open Data Commons Open Database License v1.0 |
| 商用 | 是,须遵守署名与相同方式共享条款 |
| 申请 | 公开下载 |
| 中国可用性 | 未写国别限制,任何人遵守许可即可访问 |
质量与局限
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 维护方口径 | 波形与临床库患者以自动为主、人工校正的方式匹配。原始信号文件与全库一致,对应 MIMIC-III 临床库 v1.4 |
| 已知局限 | 患者姓名与病历号常缺失,仅约三分之一记录可可靠匹配。只能识别病区,无法识别床位。波形起止时间与入出 ICU 时间不一定一致 |
所属话题
- 急危重症 › 床旁监护信号
出处
https://physionet.org/content/mimic3wdb-matched/1.0/;https://physionet.org/content/mimic3wdb-matched/view-license/1.0/。
审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队