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TWOSIDES 药物相互作用不良事件数据库
原名:TWOSIDES。
概述
TWOSIDES 由 Tatonetti 实验室发布,是 NSIDES 项目的产出之一,与 OFFSIDES 同源。它从美国 FDA 不良事件报告系统的自发报告中,计算双药组合与不良事件之间的不相称性统计。OFFSIDES 与 TWOSIDES 合计涉及 3,300 余种药物、63,000 个药物组合。每行是一对药物与一种不良事件,附报告数、比例报告比及其误差。
联合用药的不良反应在上市前试验中很难充分观察。这份数据可用于筛选可能的药物相互作用信号,为药物警戒与临床审方提供线索。它也可用作药物相互作用预测研究的数据来源。信号来自自发报告,只提示关联,因果关系要另做研究确认。
对人工智能学习的帮助
它是由自发报告计算出的聚合统计,不含个体记录,不属于 1.0 临床真实一层。药物与不良事件分别用 RxNorm 与 MedDRA 命名,能学到 2.0 规则语义。模型可以学习药物对与不良事件之间的统计关联,用于药物相互作用预测。A 或 C 为零时,比例报告比或其误差会出现 NaN、Inf 或 0,训练前要处理。数据多年未更新,内容已相当过时。数据许可未列明,使用前要确认条款。
记录形态
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 规模 | 3,300 余种药物、63,000 个药物组合 |
| 记录语言 | 无自由文本 |
| 记录来源 | 其他来源 |
| 记录单位 | 药物组合与不良事件对 |
| 时间轴 | 不适用,统计表无个体记录 |
| 结局 | 不适用,统计信号表无个体记录 |
| 专家标注 | 未列明,仅自动计算的统计量 |
| 任务环境 | 未列明 |
数据结构
表:TWOSIDES.csv.gz。
| 字段 | 含义 | 类型或取值 |
|---|---|---|
drug_1_concept_name |
药物 1 的 RxNORM 名称 | 字符串 |
drug_2_concept_name |
药物 2 的 RxNORM 名称 | 字符串 |
condition_meddra_id |
不良事件的 MedDRA 标识 | MedDRA ID |
condition_concpet_name |
不良事件的 MedDRA 名称 | 字符串 |
A |
该药物对报告了此不良事件的报告数 | 计数 |
PRR |
比例报告比 | PRR=(A/(A+B))/(C/(C+D)) |
PRR_error |
PRR 的误差估计 | 数值 |
mean_reporting_frequency |
报告此不良事件的报告占比 | A/(A+B) |
获取
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 商用 | 未列明 |
| 申请 | 公开下载 |
质量与局限
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 维护方口径 | 按倾向评分匹配构建暴露与非暴露队列,再计算 PRR 及其误差。说明 PRR 为 NaN、Inf、0 的条件 |
| 已知局限 | A 或 C 为零时 PRR 或其误差会出现 NaN、Inf 或 0。维护方称这两个资源已相当过时,计划更新 |
所属话题
- 临床药理 › 药物不良反应监测
出处
https://raw.githubusercontent.com/tatonetti-lab/nsides-release/master/README.md;http://tatonettilab.org/resources/tatonetti-stm.html;https://nsides.io。
审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队