真实世界数据研究专区 · 数据集
去标识护理记录金标准语料(Deidentified Medical Text)
原名:Deidentified Medical Text。
概述
这份语料由美国麻省理工学院计算生理学实验室等团队整理,托管于 PhysioNet。它收录 2,434 份重症监护病房护理记录,取自 MIMIC-II 数据库中 163 份随机抽取的患者记录,共约 334,000 词。文中 1,779 处受保护健康信息已全部标出,并换成逼真的替身数据。另有一版把这些信息换成类别标签。
护理记录是护士交班时录入的自由文本,常夹带姓名、日期、地点等隐私信息。这份语料是去标识软件开发与评测用的金标准。研究者可用它测算自动去标识方法的漏检与误检。
对人工智能学习的帮助
它属于 1.0 临床真实一层,文本来自真实的重症监护护理记录。它也能学到 3.0 专家判断:三名及以上专家逐份审阅,标出哪些字串属于隐私信息。模型可以从中学习识别护理文书里的姓名、日期、地点等隐私信息。数据没有结局字段,未附数据划分与评分规则。记录只来自一家医院的重症监护病房,用于其他文书类型前要另做验证。
记录形态
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 规模 | 2,434 份护理记录,约 334,000 词 |
| 记录来源 | 诊疗过程 |
| 记录单位 | 一份护理记录 |
| 时间轴 | 纵向,同一患者有多份护理记录 |
| 结局 | 无结局字段 |
| 专家标注 | 有,三名及以上专家独立逐份审阅并标出 PHI |
| 任务环境 | 未列明,作为去标识化软件评测的金标准语料,未给划分或脚本 |
数据结构
表:id-phi.phrase。
| 字段 | 含义 | 类型或取值 |
|---|---|---|
PID |
患者编号 | 每行第 1 个字段 |
Record_Number |
该患者笔记的记录号 | 每行第 2 个字段 |
PHI_Start_Location |
PHI 在笔记中的起始位置 | 每行第 3 个字段 |
PHI_End_Location |
PHI 在笔记中的结束位置 | 每行第 4 个字段 |
PHI_Type |
PHI 类型 | 每行第 5 个字段 |
PHI_Text |
PHI 文本,金标准中为替代值 | 每行第 6 个字段 |
样例
表:id-phi.phrase。
| 患者编号 | 笔记记录号 | 起始位置 | 结束位置 | 隐私信息类型 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 48 | 55 | Location |
| 1 | 1 | 192 | 196 | DateYear |
| 1 | 1 | 333 | 337 | Date |
获取
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 许可 | PhysioNet Credentialed Health Data License 1.5.0 |
| 商用 | 未列明 |
| 申请 | 须为 PhysioNet 认证用户、完成 CITI 培训并签数据使用协议 |
| 中国可用性 | 未写国别限制,须 PhysioNet 认证并签数据使用协议 |
质量与局限
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 维护方口径 | 三名及以上专家独立审阅,加自动方法多轮核查 |
所属话题
- 医疗安全边界 › 隐私与去标识
出处
https://physionet.org/content/deidentifiedmedicaltext/1.0/;https://physionet.org/content/deidentifiedmedicaltext/view-license/1.0/;https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC2526997/。
审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队