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MIMIC-III 超声心动图报告结构化数据库(ECHO-NOTE2NUM)
原名:EchoNotes Structured Database derived from MIMIC-III。
概述
这份数据由哈佛医学院、麻省理工学院等机构的研究者从 MIMIC-III 派生,托管在 PhysioNet。数据含 45,794 条超声心动图记录,其中 43,472 份为有效报告,涉及 21,572 名患者。报告来自 2001—2012 年美国波士顿贝斯以色列女执事医疗中心。每份报告按心腔、瓣膜、收缩与舒张功能等节段转为分级数值。
超声心动图的结论多写在文字报告里,难以直接用于统计。转成分级数值后,可用于研究左室收缩功能、瓣膜病变等与重症住院结局的关联。通过患者与住院编号回链 MIMIC-III,可补上检验、用药与结局信息。分级编码保留了“无法评估”和“异常但未分级”,模糊信息不必整条丢弃。
对人工智能学习的帮助
报告来自真实超声检查,属于 1.0 临床真实一层。模型可以从中学习超声报告文字与严重度分级之间的对应。数值由规则词典自动转换,编码方案与临床专家商定,但没有逐份专家标注,也未报告转换准确率。同一报告内前后矛盾的表述记为 -50,建模前要单独处理。数据只来自一家医院,结论外推前要另做验证。
记录形态
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 规模 | 43,472 份有效报告、21,572 名患者 |
| 记录语言 | 英语 |
| 记录来源 | 诊疗过程 |
| 记录单位 | 一份超声心动图报告 |
| 时间轴 | 纵向,21,572 名患者共有 43,472 份有效报告,跨度 2001—2012 年 |
| 结局 | 无结局字段,须与 MIMIC-III 串联 |
| 专家标注 | 无,仅规则自动转换 |
| 任务环境 | 无 |
数据结构
表:EchoReports.csv。
| 字段 | 含义 | 类型或取值 |
|---|---|---|
status |
检查时为住院或门诊 | 分类 |
heart rate (bpm) |
心率 | 数值,次/分 |
BSA (m2) |
体表面积 | 数值,平方米 |
LV_systolic |
左心室收缩功能 | -3、-2、-1、0、1、2、3,冲突记 -50 |
LV_cavity |
左心室腔大小 | 同上分级编码 |
AV_stenosis |
主动脉瓣狭窄 | -3、-2、0、1、2、3 |
RV_volume_overload |
右心室容量负荷过重 | -3、0、1 |
RA_pressure |
右心房压力 | Schema 1 分级编码 |
样例
表:EchoReports.csv。
合成样例,非真实记录。
| 检查时住院或门诊 | 心率(次/分) | 体表面积(m²) | 左室收缩功能 | 左室腔大小 | 主动脉瓣狭窄 | 右室容量负荷过重 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Inpatient | 88 | 1.92 | 2 | 0 | 0 | 0 |
| Outpatient | 64 | 1.75 | 0 | 0 | 3 | 0 |
| Inpatient | 102 | 2.05 | -50 | 1 | — | 1 |
获取
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 许可 | PhysioNet Credentialed Health Data License 1.5.0 |
| 商用 | 未列明 |
| 申请 | 须通过凭证审核、完成 CITI 培训并签数据使用协议 |
| 中国可用性 | 未写地域限制,个人须过凭证审核,不得共享访问 |
质量与局限
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 维护方口径 | 按与临床专家商定的分层数值编码赋值。同一报告内矛盾表述记为 -50 |
| 已知局限 | 仅来自单中心 2001—2012 年数据。数值由规则词典转换,未报告转换准确性 |
所属话题
- 检验、影像与病理判读 › 心脏检查报告
出处
https://physionet.org/content/echo-note-to-num/1.0.0/;https://physionet.org/content/echo-note-to-num/view-license/1.0.0/。
审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队