医院获得性感染预测因素匹配回顾性队列数据集

这份数据由哈佛医学院、麻省总医院、布莱根妇女医院等机构的研究者发布，托管在 PhysioNet。数据取自 Mass General Brigham 医疗体系的临床数据仓库，覆盖 2015 年 5 月至 2024 年 7 月入院的全部成人住院患者。研究者按匹配病例对照设计整理 11 种目标病原体，每条观测为一次住院。环境分析含 14,923 例病例与 28,480 条对照记录，患者分析含 16,933 例病例与 39,372 条对照记录。

病例定义为入室后第 3—30 天目标病原体培养阳性，出院后的阳性培养也计入。这份数据可用于研究病房同住者的定植压力、既往抗生素暴露与院内获得耐药菌之间的关系。两套匹配方案分别平衡抗生素暴露与病房因素，便于分开估计环境与用药两类风险。

数据来自真实住院电子病历，属于 1.0 临床真实一层。模型可以从中学习病房环境、用药史和合并症如何共同影响院内感染风险。病例与对照按培养结果规则定义，没有专家标注，也没有给定的训练与测试划分。匹配设计下的病例比例由研究者设定，模型给出的绝对风险不能直接外推到全体住院人群。数据只来自一个医疗体系，原始微生物与用药表不随数据提供。

项目	内容
规模	16,933 例病例匹配 39,372 条对照记录
记录语言	无自由文本
记录来源	诊疗过程
记录单位	一次住院
时间轴	单次，每条观测为一次住院，含入院前回溯特征
结局	入室后第 3—30 天目标病原体培养阳性，随访最长 30 天
专家标注	无，病例与对照按培养结果规则定义
任务环境	无

表：HO_infxn_analysis.csv。

字段	含义	类型或取值
analysis	匹配方案	Categorical，environmental／patient
run	目标病原体	Categorical，11 种目标病原体
group	病例或对照	Categorical，Case／Control
duration	在首个病房的停留时长	Numerical，days，2–30
time_to_infxn	入室至目标病原体培养阳性的时间，仅病例有值	Numerical，days，3.1–30／N/A
any_surgery	既往 90 天内是否手术	Binary，1／0
any_abx_0_60	既往 60 天内是否用过抗生素	Binary，1／0
elix_index_mortality	Elixhauser 指数	Numerical

表：HO_infxn_analysis.csv。

合成样例，非真实记录。

匹配方案	目标病原体	病例或对照	首个病房停留天数	入室至培养阳性天数	既往 90 天手术	既往 60 天用抗生素	Elixhauser 指数
environmental	MRSA	Case	9	6.5	1	1	14
environmental	MRSA	Control	8	N/A	0	1	9
patient	C. difficile	Case	12	7.2	0	1	21

项目	内容
许可	PhysioNet Credentialed Health Data License 1.5.0
商用	未列明
申请	须为 PhysioNet 凭证用户、完成 CITI 培训并签数据使用协议

项目	内容
维护方口径	明确纳排标准、病例对照定义与每例最多 3 个对照的匹配规则。药敏表型依 CLSI M100 判定
已知局限	数据仅来自 Mass General Brigham 体系，结果可能受站点因素影响。原始依赖表不随数据提供

• 感染性疾病　›　医院感染与抗菌药物耐药

https://physionet.org/content/hospital-onset-infection/1.0.0/；https://physionet.org/content/hospital-onset-infection/view-license/1.0.0/。