2019 年 PhysioNet/CinC 挑战赛脓毒症早期预测数据集

原名:Early Prediction of Sepsis from Clinical Data: The PhysioNet/Computing in Cardiology Challenge 2019。

发布时间
2019-08-05
数据集规模
公开训练集 40,336 名 ICU 患者,逾 250 万个小时窗
更新日期
2026-10-25
所属话题
急危重症 › 脓毒症

概述

这份数据来自 2019 年 PhysioNet/Computing in Cardiology 挑战赛,患者来自 Beth Israel Deaconess 医学中心与埃默里大学医院。公开训练集收录 40,336 名 ICU 患者,其中训练集 A 20,336 名、训练集 B 20,000 名。每名患者一个文件,每行是一个小时的记录,含 8 项生命体征、26 项检验、6 项人口学变量和脓毒症标签。另有 24,819 名患者作为隐藏测试集,未公开。

脓毒症识别得越早,抗感染与复苏治疗就能越早开始。这份数据按 Sepsis-3 定义生成逐小时标签,发病前 6 小时起记为 1。它可用于研究脓毒症发病前生命体征与检验的变化。挑战赛还给出按临床效用计分的评分函数,可用于比较不同的早期预警算法。

对人工智能学习的帮助

它是 ICU 逐小时的真实监测与检验记录,属于 1.0 临床真实一层。挑战赛给定公开训练集、隐藏测试集与效用函数评分代码,能学到 4.0 任务环境。模型可以学习在缺测普遍的时间序列中提前识别脓毒症,评分按预警是否及时给分。标签由 Sepsis-3 规则自动生成,没有另做的专家判定,数据中刻意保留了缺失与错误值。挑战赛结果显示,跨医院系统的泛化仍是难题。

记录形态

项目 内容
规模 公开训练集 40,336 名 ICU 患者,逾 250 万个小时窗
记录语言 无自由文本
记录来源 诊疗过程
记录单位 一次 ICU 住院
时间轴 单次,一次 ICU 住院的逐小时记录,最长 2 周
结局 ICU 期间按 Sepsis-3 定义生成的逐小时脓毒症标签,无随访
专家标注 无,仅自动标签
任务环境 有,固定划分、效用函数评分脚本与排行榜

数据结构

表:training/p00101.psv 等逐患者文件。

字段 含义 类型或取值
HR 心率 beats per minute
O2Sat 脉搏血氧饱和度 %
MAP 平均动脉压 mm Hg
Lactate 乳酸 mg/dL
Age 年龄 Years;90 岁及以上记为 100
Gender 性别 Female (0) 或 Male (1)
ICULOS 入 ICU 后的小时数 hours since ICU admit
SepsisLabel 脓毒症标签 t ≥ t_sepsis − 6 时为 1,否则为 0

样例

表:training_setA/p000001.psv。

心率 脉搏血氧饱和度 收缩压 平均动脉压 呼吸频率 年龄 性别 入院至入 ICU 小时数 入 ICU 后小时数 脓毒症标签
97 95 98 75.33 19 83.14 0 -0.03 2 0
89 99 122 86 22 83.14 0 -0.03 3 0
90 95 NaN NaN 30 83.14 0 -0.03 4 0

获取

项目 内容
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质量与局限

项目 内容
维护方口径 以 Sepsis-3 规则统一定义发病时刻并生成逐小时标签。论文报告各医院变量密度与分布差异
已知局限 缺失与错误值被有意保留。第三家医院数据与测试集未公开。跨医院系统的泛化仍是难题

所属话题

出处

https://physionet.org/content/challenge-2019/1.0.0/;https://physionet.org/files/challenge-2019/1.0.0/physionet_challenge_2019_ccm_manuscript.pdf;https://physionet.org/content/challenge-2019/view-license/1.0.0/。

审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队