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慢阻肺遗传流行病学研究(COPDGene)
原名:COPDGene Study。
概述
COPDGene 研究由 National Jewish Health 与布莱根妇女医院主持,美国国家心肺血液研究所资助。2008 年 2 月起在美国 21 个临床中心招募 45—80 岁、吸烟≥10 包年的非西班牙裔白人与非裔美国人。第 1 期招募 10,371 人,截至第 3 期累计胸部 CT 40,000 余次。5 年随访的第 2 期有 6,153 人,10 年随访的第 3 期有 4,763 人,15 年随访的第 4 期计划 3,500 人。
数据把吸气与呼气胸部 CT、全基因组分型、生理测量与问卷放在同一批吸烟者身上。研究者用它探索慢阻肺的影像亚型、遗传易感性与疾病进展。按 5 年与 10 年回访,可观察肺气肿与气道病变的变化。
对人工智能学习的帮助
它把定量 CT、基因型与肺功能放在同一个纵向队列里。模型可以从中学习肺气肿百分比等影像指标与 GOLD 分级、肺功能下降之间的关系。数据由研究采集,不属于 1.0 临床真实一层,其他三层也都不计入。影像是否有专家判读标注未列明。研究只纳入吸烟≥10 包年的非西班牙裔白人与非裔美国人,随访人数逐期下降。
记录形态
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 规模 | 第 1 期招募 10,371 人,截至第 3 期累计胸部 CT 40,000 余次 |
| 记录来源 | 研究方案采集 |
| 记录单位 | 个体 |
| 时间轴 | 纵向,第 1 期招募后做 5 年与 10 年随访,15 年随访计划中 |
| 结局 | 按方案 5 年与 10 年回访的疾病表型与影像 |
| 任务环境 | 无 |
数据结构
表:COPDGene_Subject_Phenotypes(dbGaP pht002239.v5)。
| 字段 | 含义 | 类型或取值 |
|---|---|---|
visitnum |
随访序号,与研究分期对应 | numeric |
phase_study |
所属研究分期 | string:P1、P2、P3、P3B |
smoking_status |
三分类吸烟状态 | encoded value:0=从不吸烟,1=既往吸烟,2=当前吸烟 |
age_visit |
本次随访时年龄 | numeric,years |
finalgold_baseline |
基线 GOLD 分级 | encoded value:-2 至 4,含 PRISm=-1 |
FEV1pp_post |
支气管舒张后 FEV1 占预计值百分比 | numeric,% |
pctEmph_Vida |
VIDA 软件测得全肺 −950 HU 肺气肿百分比 | numeric,% |
distwalked |
六分钟步行距离 | numeric,Ft |
样例
表:COPDGene_Subject_Phenotypes。
合成样例,非真实记录。
| 随访序号 | 研究分期 | 随访时年龄 | 吸烟状态 | 基线 GOLD 分级 | 舒张后 FEV1 占预计值(%) | 肺气肿百分比(%) | 六分钟步行距离(ft) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | P1 | 58 | 2 | 0 | 94.2 | 1.8 | 1650 |
| 1 | P1 | 67 | 1 | 2 | 61.5 | 9.7 | 1320 |
| 1 | P1 | 72 | 1 | 4 | 24.3 | 31.6 | 610 |
获取
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 许可 | dbGaP Data Use Certification Agreement |
| 商用 | 未列明 |
| 申请 | 经 dbGaP Authorized Access 申请,须签数据使用协议并经机构审批 |
质量与局限
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 维护方口径 | 按 GOLD 标准与统一纳排标准招募,CT 定量评估肺气肿与气道病变 |
| 已知局限 | 只纳入 45—80 岁、吸烟 10 包年以上的非西班牙裔白人与非裔美国人。随访人数逐期下降 |
所属话题
出处
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000179;https://copdgene.org/;https://copdgene.org/study-design/。
审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队