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简要住院病程摘要数据集(MIMIC-IV-Ext-BHC)
原名:MIMIC-IV-Ext-BHC v1.2.0。
概述
这份数据由斯坦福大学、得克萨斯大学奥斯汀分校等机构的研究者从 MIMIC-IV-Note 派生,托管在 PhysioNet。数据含 270,033 对出院记录与简要住院病程(BHC),源笔记采集于 2008—2019 年。输入文本平均 2,267±914 个词元,目标摘要平均 564±410 个词元。研究者人工抽查了 100 条预处理结果,临床团队复核了 30 对记录。
简要住院病程是出院小结里概括住院经过的一段。这份数据可用于训练和评估由出院记录生成住院病程摘要的方法。它也可用于研究长篇病历的分段、信息取舍与压缩。
对人工智能学习的帮助
输入和目标都取自医生在真实住院中写下的出院记录,属于 1.0 临床真实一层。模型可以从中学习医生如何把一次住院的检查、治疗与转归写成一段病程摘要。目标段落由正则表达式从原文切出,没有专家另写的参考摘要。数据未见给定的划分与评测指标。数据只来自一家医院,书写习惯不同的机构使用前要另做验证。
记录形态
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 规模 | 270,033 对出院记录与简要住院病程 |
| 记录来源 | 诊疗过程 |
| 记录单位 | 一对出院记录与简要住院病程 |
| 时间轴 | 单次,每条为一份出院记录及其住院病程段 |
| 结局 | 无结局字段 |
| 专家标注 | 无,仅自动标签,目标段由正则表达式切出 |
| 任务环境 | 未列明 |
数据结构
表:mimic-iv-bhc.csv。
| 字段 | 含义 | 类型或取值 |
|---|---|---|
note_id |
行唯一编号,与 MIMIC-IV-Note 的 note_id 对应 | 标识符 |
input |
预处理后的出院记录正文,不含 BHC | 文本 |
target |
清洗后的简要住院病程(BHC) | 文本 |
input_tokens |
输入文本的词元数 | 整数 |
target_tokens |
目标 BHC 的词元数 | 整数 |
样例
表:mimic-iv-bhc.csv。
合成样例,非真实记录。
| 记录编号 | 出院记录正文(节选) | 简要住院病程(节选) | 输入词元数 | 目标词元数 |
|---|---|---|---|---|
| 10000001-DS-1 | Patient admitted with acute on chronic heart failure, diuresed with IV furosemide … | 2140 | 512 | |
| 10000002-DS-2 | Patient underwent laparoscopic appendectomy without complication … | 1420 | 260 | |
| 10000003-DS-1 | Patient treated for urosepsis with IV ceftriaxone, cultures grew E. coli … | 3050 | 880 |
获取
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 许可 | PhysioNet Credentialed Health Data License 1.5.0 |
| 商用 | 未列明 |
| 申请 | 须通过凭证审核、完成 CITI 培训并签数据使用协议 |
质量与局限
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 维护方口径 | 剔除 BHC 少于 100 字符的笔记。人工抽查 100 条,临床团队复核 30 对未报告问题 |
| 已知局限 | 仍有极小再识别残余风险。单一机构来源,外推受限 |
所属话题
- 医疗工作流程 › 病历文本标注与抽取
出处
https://physionet.org/content/labelled-notes-hospital-course/1.2.0/;https://physionet.org/about/faqs/;https://physionet.org/content/labelled-notes-hospital-course/view-license/1.2.0/。
审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队