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SimSUM 结构化与非结构化模拟病历基准
原名:SimSUM。
概述
这份数据由比利时根特大学团队发布,公开在 GitHub 与 Hugging Face,早期版本名为 SynSUM。它含 10,000 条模拟患者记录,情境为基层医疗中的呼吸系统疾病就诊。每条记录有表格变量、一篇临床笔记及其精简版,并附症状片段标注。表格变量由领域专家定义的贝叶斯网络抽样,笔记由大语言模型生成。
基层就诊记录同时有结构化变量和自由文本。这份数据可用于研究如何把两类信息结合起来,做诊断或治疗预测。变量间的依赖关系由贝叶斯网络给定,可用于检验方法能否从文本中还原这些关系。
对人工智能学习的帮助
它是完全合成的数据,不属于 1.0 临床真实一层。贝叶斯网络的结构与参数由领域专家定义,5 名全科医生评审过 30 篇笔记,能学到 3.0 专家判断。模型能从中练习把笔记里的症状描述对应到结构化变量。仓库给出训练 8,000 条、测试 2,000 条的划分。数据不反映真实病历的复杂与噪声,不应用于评估临床模型或训练临床决策支持系统。
记录形态
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 规模 | 10,000 条合成患者记录 |
| 记录语言 | 英语 |
| 记录来源 | 合成数据 |
| 记录单位 | 一次合成就诊 |
| 时间轴 | 单次,每条为一次就诊摘录,刻意去掉时间维度 |
| 结局 | 有诊断、抗生素治疗与居家天数变量,无结局随访 |
| 专家标注 | 有,笔记由大语言模型生成,5 名全科医生评审 30 篇笔记 |
| 任务环境 | 有,固定划分训练 8,000 条与测试 2,000 条 |
数据结构
表:SimSUM.csv。
| 字段 | 含义 | 类型或取值 |
|---|---|---|
pneu |
肺炎诊断 | yes/no |
cold |
普通感冒诊断 | yes/no |
dysp |
呼吸困难症状 | yes/no |
fever |
发热症状 | high/low/none |
asthma |
哮喘基础病 | yes/no |
policy |
医生开抗生素的先验倾向 | high/low |
antibiotics |
是否开具抗生素 | yes/no |
days_at_home |
因病居家天数 | 离散值(0-...) |
样例
表:SimSUM.csv。
| 哮喘 | 季节 | 肺炎 | 普通感冒 | 咳嗽 | 发热 | 鼻部症状 | 开抗生素倾向 | 开具抗生素 | 居家天数 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| no | summer | no | no | no | high | no | yes | yes | 2 |
| no | summer | no | no | no | none | no | yes | no | 2 |
| no | summer | no | no | no | low | yes | no | no | 2 |
获取
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 许可 | CC BY 4.0 |
| 商用 | 是,依 CC BY 4.0 许可文本 |
| 申请 | 公开下载 |
质量与局限
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 维护方口径 | 5 名全科医生评审随机抽取的 30 篇生成笔记。症状片段自动抽取经 100 篇人工核查,精确率 94.06% |
| 已知局限 | 完全合成,不反映真实电子病历的复杂性与噪声。不应用于评估临床模型或训练临床决策支持系统 |
所属话题
- 特殊话题 › 合成数据
出处
https://huggingface.co/datasets/prabaey/simsum;https://github.com/prabaey/SimSUM;https://arxiv.org/abs/2409.08936;https://arxiv.org/html/2409.08936;https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC12713242/。
审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队