真实世界数据研究专区 · 数据集
MIMIC-IV 出院小结姓名去标识标注数据集
原名:Annotated MIMIC-IV discharge summaries for a study on deidentification of names。
概述
这份数据由麻省理工学院团队发布,托管在 PhysioNet。作者从 MIMIC-IV 预发布版抽取 100 份出院小结,整理成标出姓名位置的模板,男女各 50 份。作者再按美国姓名分布构建 16 个姓名集,每集 20 个名,填充生成 16,000 份带标签的评测文书。数据还附有多义姓名评测集、微调用数据和 9 种去标识方法的预测输出。
医院共享病历前要先去除姓名等受保护健康信息。这份数据可用于检验去标识工具对不同性别、种族、流行程度和年代的姓名是否同样有效。研究者可以借它比较各种去标识方法在不同人群姓名上的漏检差异。
对人工智能学习的帮助
文书由模板填充生成,不属于 1.0 临床真实一层。它能学到 3.0 专家判断,作者逐份标注了模板中姓名与其他受保护信息的位置。模型可以从中学习在临床文本里识别姓名,并检验识别率是否因人群而异。姓名集只反映美国的姓名分布,种族匹配依赖按揭申请数据,性别只分两类。作者要求不得用姓名集做人口学推断。
记录形态
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 规模 | 100 份出院小结模板、16,000 份评测文书 |
| 记录来源 | 合成数据 |
| 记录单位 | 出院小结模板或填充文书 |
| 时间轴 | 单次,不含同一患者多时点记录 |
| 结局 | 无结局字段 |
| 专家标注 | 有,作者人工标注 100 份模板中的姓名与其他 PHI 位置 |
| 任务环境 | 有,16,000 份带标签评测文书,另有微调用训练与验证模板 |
数据结构
表:general/input/names-first.csv。
| 字段 | 含义 | 类型或取值 |
|---|---|---|
SetID |
名字集编号 | 1–16 |
Gender |
名字集对应的性别 | M / F |
Race |
名字集对应的种族 | white / black / asian / hispanic |
Popularity |
名字的流行程度档 | top / medium / bottom |
Decade |
名字流行的年代 | 1940s / 1970s / 2000s |
Name |
名 | 文本 |
Rank |
该名在同年代同性别中的排名 | 整数 |
Count |
该名在同年代同性别中的出现次数 | 整数 |
样例
表:general/input/names-first.csv。
合成样例,非真实记录。
| 姓名集编号 | 性别 | 种族 | 流行程度 | 年代 | 名 | 排名 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | M | white | top | 2000s | Jacob | 1 |
| 2 | F | white | top | 2000s | Emily | 1 |
| 16 | F | white | top | 1940s | Mary | 1 |
获取
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 许可 | PhysioNet Credentialed Health Data License 1.5.0 |
| 商用 | 未列明 |
| 申请 | 须为 PhysioNet 认证用户、完成 CITI 培训并签数据使用协议 |
| 中国可用性 | 未写地域限制,须成为 PhysioNet 认证用户 |
质量与局限
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 维护方口径 | 出院小结在 MIMIC-IV 公开前抽取,被评测模型未见过。准备与分析代码以开源许可公开 |
| 已知局限 | 仅限美国姓名分布,结论须在其他场景复现。种族匹配依赖按揭申请人数据,偏向经济条件较好人群。只用二元性别与标准化种族类别 |
所属话题
- 医疗安全边界 › 隐私与去标识
出处
https://physionet.org/content/discharge-summary-templates/1.0/;https://physionet.org/content/discharge-summary-templates/view-license/1.0/。
审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队