FIDDLE 预处理的 MIMIC-III 与 eICU 特征数据集

密歇根大学团队用开源工具 FIDDLE，把 MIMIC-III 与 eICU-CRD 的 ICU 结构化记录转成稀疏特征矩阵，托管在 PhysioNet。MIMIC-III 部分以 17,710 名患者、23,620 次 ICU 入住为来源，取 2008—2012 年 MetaVision 时期。eICU 部分来源为 139,367 名患者、200,859 次 ICU 入住，覆盖 200 个 ICU，时间为 2014—2015 年。每个任务给出队列、标签与特征，时间相关特征最多约 8,000 维。

重症临床常要在患者入住 ICU 后不久判断其是否会恶化。数据给出 5 个预测任务，即 48 小时院内死亡，以及 4 小时、12 小时的急性呼吸衰竭和休克。任务定义与重症医师商定。研究者可以在同一套特征上比较不同预测方法，也可复现原论文实验。

它来自两个重症数据库的真实诊疗记录，属于 1.0 临床真实一层。模型可以从入住后前 4、12 或 48 小时的结构化记录特征中学习病情恶化的早期信号。标签由结构化表按规则派生，没有逐例专家判定。数据未给固定划分和评测规则，不同研究的结果要按同一切分重算后才能比较。MIMIC-III 部分只取 MetaVision 时期，两部分都不含病历文本。

项目	内容
规模	MIMIC-III 来源 23,620 次 ICU 入住，eICU 来源 200,859 次
记录语言	无自由文本
记录来源	诊疗过程
记录单位	一次 ICU 入住
时间轴	单次，取入住后前 4、12 或 48 小时的特征
结局	院内死亡、急性呼吸衰竭与休克标签，无随访
专家标注	无，仅自动标签
任务环境	未列明

表：features/{task}/。

字段	含义	类型或取值
s.npz	时间不变特征	N × d 稀疏矩阵
s.feature_names.json	d 个时间不变特征的名称	字符串列表
s.feature_aliases.json	时间不变特征的别名映射	JSON
X.npz	时间相关特征	N × L × D 稀疏张量
X.feature_names.json	D 个时间相关特征的名称	字符串列表
X.feature_aliases.json	时间相关特征的别名映射	JSON

项目	内容
许可	PhysioNet Credentialed Health Data License 1.5.0
商用	未列明
申请	须通过凭证审核、完成 CITI 培训并签数据使用协议
中国可用性	未写地域限制，须 PhysioNet 认证、CITI 培训并签数据使用协议

项目	内容
维护方口径	5 个预测任务与重症医师商定。用 FIDDLE 默认设置统一生成特征，附代码快照
已知局限	MIMIC-III 仅取 2008—2012 年 MetaVision 时期。只用结构化表，特征按固定默认设置生成

• 急危重症　›　重症派生数据与预测基准

https://physionet.org/content/mimic-eicu-fiddle-feature/1.0.0/；https://physionet.org/content/mimic-eicu-fiddle-feature/view-license/1.0.0/。