真实世界数据研究专区 · 数据集
MIMIC-III 入院记录免疫抑制疾病与用药标注数据集
原名:Immunosuppressive Condition and Medication Annotations for Admission Notes in the MIMIC-III Database。
概述
这份数据由西北大学费恩伯格医学院的研究者发布,托管在 PhysioNet。数据含 200 份入院记录,来自 MIMIC-III 2001—2012 年诊断肺炎并接受机械通气的内科 ICU 住院,每次住院一份。每份记录标注 7 种免疫抑制疾病与 6 种免疫抑制药物,共 13 个变量,取值为是、否或不确定。每份由两名标注者独立标注,分歧与不确定项由重症主治医师复核,平均分歧率 0.65%。
免疫抑制状态影响重症肺炎的病原谱和经验治疗选择,但常只写在病历文字里。这份数据可用于评估从入院记录抽取免疫抑制疾病与用药的方法。通过住院编号回链 MIMIC-III,也可研究免疫抑制患者的肺炎病程与结局。
对人工智能学习的帮助
标注对象是真实入院记录,属于 1.0 临床真实一层。每个变量由两人独立判定、主治医师复核,能学到 3.0 专家判断。模型可以从中学习在长篇记录里识别移植史、血液肿瘤和免疫抑制药物。数据不含皮质激素、骨髓抑制化疗等其他免疫抑制原因,也没有给定的评测划分。队列限于机械通气的肺炎患者,各类免疫抑制的比例与一般重症人群不同。
记录形态
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 规模 | 200 份入院记录,每份标注 13 个变量 |
| 记录来源 | 诊疗过程 |
| 记录单位 | 一份入院记录 |
| 时间轴 | 单次,每次住院取一份入院记录 |
| 结局 | 无结局字段,须经标识符回链 MIMIC-III |
| 专家标注 | 有,每份由两人独立标注,分歧由重症主治医师复核 |
| 任务环境 | 未列明 |
数据结构
表:MIMIC-III-Ext-Immunosuppressive-Conditions-Medications.csv。
| 字段 | 含义 | 类型或取值 |
|---|---|---|
HADM_ID |
MIMIC-III v1.4 住院编号 | integer |
ROW_ID |
MIMIC-III v1.4 NOTEEVENTS 表索引 | integer |
Acute leukemia |
有急性淋巴或髓系白血病病史 | 1 = Yes,0 = No,0.5 = Unsure |
Lymphoma |
有霍奇金或非霍奇金淋巴瘤病史 | 1 = Yes,0 = No,0.5 = Unsure |
Solid organ transplant |
有肾、肝、心或肺移植史 | 1 = Yes,0 = No,0.5 = Unsure |
Mycophenolate |
入院前六个月内用过霉酚酸类药 | 1 = Yes,0 = No,0.5 = Unsure |
Tacrolimus |
入院前六个月内用过他克莫司 | 1 = Yes,0 = No,0.5 = Unsure |
样例
表:MIMIC-III-Ext-Immunosuppressive-Conditions-Medications.csv。
合成样例,非真实记录。
| 住院编号 | 急性白血病 | 淋巴瘤 | 实体器官移植 | 霉酚酸类 | 他克莫司 |
|---|---|---|---|---|---|
| 100001 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 |
| 100002 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| 100003 | 0 | 0.5 | 0 | 0 | 0 |
获取
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 许可 | PhysioNet Credentialed Health Data License 1.5.0 |
| 商用 | 未列明 |
| 申请 | 须通过凭证审核、完成 CITI 培训并签数据使用协议 |
质量与局限
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 维护方口径 | 每份记录由两名标注者独立标注,分歧由主治医师复核。标注者间平均分歧率 0.65% |
| 已知局限 | 未覆盖皮质激素、骨髓抑制化疗等原因。队列限机械通气肺炎患者,各类比例与一般重症人群不同 |
所属话题
- 医疗工作流程 › 病历文本标注与抽取
出处
https://physionet.org/content/immunosuppressive-annotations/1.0.0/;https://physionet.org/content/immunosuppressive-annotations/view-license/1.0.0/。
审校:数巨有谱真实数据研究团队|编辑:数巨有谱AI团队