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[01 · SHP-MED-05-032]

临床实体与关系标注数据

临床文书正文上的实体与关系标注。实体按字符区间定位,各带实体类型与断言状态。关系写明方向与证据状态,两端各指向一个实体提及。标注指南、标注版本与复核记录随标注交付。可用于实体识别与关系抽取模型训练、病历结构化引擎测试与知识图谱构建。

临床文本与标准化 · 评估与研究使用许可 · 更新日期 2026-08-05

8
实体
46
字段
1
实体关系
05
所属体系
[02 · 产品说明]

读懂数据结构与交付边界

以下内容来自产品说明书,包含数据拓扑、字段字典、脱敏样例、使用场景及定制方式。

[01]

数据产品概览

数量内容
实体8标注文书 · 标注指南 · 标注版本 · 实体提及 · 关系提及 · 复核记录 · 数据质量项 · 来源沿袭
字段46交付范围内的字段总数
实体关系1关系提及须有原文证据才成立,每条带证据状态

交付与供应方式

  1. 数据集交付:清单 CSV/Parquet + 单一对象文件夹 + Meta.jsonl/Parquet
  2. API 调用
  3. Token 计量
  4. 数巨有谱可信数据空间连接器合约使用

权利与来源

  • 数据取得方式:数据资源持有方书面授权
  • 数据来源机构:医疗机构(含等级医院、社区医院及康复机构、疾控机构)
  • 数据加工机构:数巨有谱或数据资源持有方
  • 数据经营机构:数巨有谱(经营权权利人)
[02 · DATA CONTENT]

数据内容与字段结构

在同一位置切换字段字典、实体血缘与脱敏样例,避免重复铺陈造成页面过长。

数据血缘拓扑

实体与连接关系分层呈现:上方先识别全部数据对象,下方逐条阅读关系基数,避免连线交叠、标签遮挡或内容被裁切。

8 个实体7 条连接响应式完整展示

实体概览

核心实体以品牌蓝标识
01核心实体

标注文书

正文/坐标契约

02关联实体

实体提及

类型/断言/字符区间

03关联实体

关系提及

方向/关系类型/证据

04关联实体

标注指南

版本/是否定版

05关联实体

标注版本

成套交付单位

06关联实体

复核记录

整版复核结论

07辅助实体

数据质量项

性质与口径说明

08辅助实体

来源沿袭

正文对象/逻辑定位

连接关系

每条关系独占一行,基数置于两实体之间

实体 A01

标注文书

正文/坐标契约

1—n
实体 B

实体提及

类型/断言/字符区间

实体 A02

实体提及

类型/断言/字符区间

1—n
实体 B

关系提及

方向/关系类型/证据

实体 A03

标注指南

版本/是否定版

1—n
实体 B

标注版本

成套交付单位

实体 A04

标注版本

成套交付单位

1—n
实体 B

复核记录

整版复核结论

实体 A05

标注版本

成套交付单位

1—n 实体与关系按标注版本成套交付,跨版本不混用
实体 B

关系提及

方向/关系类型/证据

实体 A06

标注文书

正文/坐标契约

1—n
实体 B

数据质量项

性质与口径说明

实体 A07

标注文书

正文/坐标契约

1—1
实体 B

来源沿袭

正文对象/逻辑定位

核心实体关联实体1—1 / 1—n / n—1 表示关系基数
查看关系语义清单
基数关系语义
标注文书1—n实体提及正文字符坐标系上的实体提及
实体提及1—n关系提及关系两端都指向已存在的实体提及
标注指南1—n标注版本一版标注指南之下产出的标注版本
标注版本1—n复核记录该版标注的历次复核记录
标注版本1—n关系提及实体与关系按标注版本成套交付,跨版本不混用
标注文书1—n数据质量项文书层的性质与口径登记
标注文书1—1来源沿袭文书级来源沿袭与正文对象

实体提及挂在文书正文的字符坐标系上。关系提及连接两个已存在的实体提及,写明方向,须有原文证据才建立。指南、标注版本与复核记录共同界定一批标注在什么口径下产出、经没经过复核。坐标契约版本与正文内容校验值共同保证偏移可回放,正文一改旧偏移即失效。

[03]

使用场景

实体识别与关系抽取的监督信号组织

医疗科技企业 · 医疗信息抽取模型团队

  • 否定也建实体:断言状态与实体本身分列。「无胸痛」「无咯血」中的胸痛、咯血照样成为实体,断言记为否定
  • 用药三要素各自成边:药品与剂量、频次、给药途径分别建实体再连边。模型可输出逐项可核对的结构
  • 每条边都要原文证据:关系须有原文证据才建立。证据状态随每条关系一并保存
  • 证据范围随边走:每条关系标明证据落在同句还是跨句,跨句关系可单独抽出做难度分层
  • 候选与已复核分层:规则或词典产生的候选与人工已复核结果分列。可先用候选做预训练,再用已复核做对齐

获得:断言、方向与证据三者都可监督的抽取训练信号

病历文本转结构化字段的口径参照

三甲医院 · 临床科研数据平台

  • 标注口径成文可搬:指南版本与标注版本一同交付。院内自建标注可直接以此为口径起点,不必从零约定边界
  • 过敏与未使用分开:过敏药品与因过敏而禁用的药物类别各建实体。两者以禁忌关系相连,禁用来由可直接读取
  • 数值挂到被测项上:体温这类测量值以关系挂到「发热」这一症状。抽取结果能回答「哪个指标的值」
  • 检查与所见分列:影像所见与做出该所见的检查手段各建实体并连边。统计所见时可只取所见一侧
  • 存疑即可回原句:每条结构化结果带字符区间与片段指纹,科研人员对结果存疑时能直接回到原句核对

获得:可直接搬用的标注口径与逐条可回原文的结构化结果

结构化引擎的坐标对齐与回归用例

医疗信息化企业 · 病历结构化产品团队

  • 坐标契约先对齐:偏移按 Unicode 码位、左闭右开。接入前按此契约核对自家分词与偏移口径,两侧字符计数方可一致
  • 正文一改即失效:正文内容校验值与偏移绑定。正文更新后校验值即对不上,产品可据此提示需要重标
  • 成套取用可对照:实体与关系按标注版本成套交付。抽取规则升级后,新旧版本可并行跑同一份正文做结果对照
  • 易错处有现成实例:否定范围、药品与药物类别的从属、过敏禁忌三处最易出错。本批中各有实例,可直接作回归用例

获得:坐标口径明确、可版本对照的结构化引擎测试底料

从文本证据出发的图谱边构建

医学知识工程团队 · 临床知识图谱构建

  • 每条边落到句子:边可回指到具体原文区间。图谱中的关系可逐条回溯到出处
  • 类别与个体分层:药品与药物类别以从属关系相连,图谱里「青霉素」与「β内酰胺类」既区分又连接
  • 方向不可省略:头尾实体分列,用药与疾病、所见与检查这类有方向的边在合并时不会被压成无向边
  • 否定实体另行安置:被否定的实体保留为「已明确排除」的记录。可供后续否定推理使用
  • 口径版本可追:指南与标注版本随边交付,图谱扩充时能分辨哪些边出自哪一版口径

获得:每条边可追到原句、方向与断言都不丢失的图谱构建底料

[04]

定制与定向

  • 是否支持定制:是
  • 标注层次(单选):只交付实体提及 / 实体提及+关系提及
  • 其他定制项(多选):实体类型范围 / 关系类型范围 / 文书类型范围 / 断言与体验者属性 / 跨句关系比例
  • 最低定制数量:5,000 份标注文书
  • 预标与人工复核:是否附带规则或词典预标结果、以及预标与人工复核结果的分列方式,按项目确定
  • 其他可定制项:与项目商务确定
[05]

去标识化与交付

  1. 直接标识符移除:姓名、证件号码、联系方式、住址
  2. 间接标识符不可逆映射:患者标识、就诊号、报告单号
  3. 时间平移:整体平移并保持时序与时间间隔
  4. 机构与医师信息去除或泛化
  5. 自由文本二次核查:叙述内容中的标识信息
  6. 可按项目追加 K-匿名等泛化处理,匿名化的判定与出具方式随项目约定
  7. 正文在标注之前完成去标识化,实体标注不覆盖姓名、证件、联系方式等直接标识
  8. 正文中的日期统一平移,保序保间隔;时间类实体的偏移随替换后的正文重算
  9. 医师姓名与工号改为角色占位,占位本身不参与实体标注
  • 加密通道交付:支持
[06]

关联数据集

  • SHP-MED-05-031 临床文书分类与章节切分数据——提供被标注文书的版本与章节坐标
  • SHP-MED-05-034 诊断、操作与药品术语标准化数据——把标注出的术语接到标准编码体系
  • SHP-MED-06-038 临床信息抽取训练数据——以标注为底、按任务结构组织的抽取训练样本
[07]

常见问题

临床实体与关系标注数据包含哪些内容?

临床实体与关系标注数据(SHP-MED-05-032)在临床文书正文上标注实体与关系:实体按字符区间定位,覆盖症状、疾病、药品、检查操作、影像所见、剂量频次等类型并带断言状态;关系写明方向与证据状态,标注指南与复核记录随数据交付。

临床实体与关系标注数据适合训练什么模型?

适合实体识别与关系抽取模型训练,否定实体、用药三要素连边、跨句关系分层都有监督信号;也适合病历结构化引擎的坐标对齐与回归测试、临床知识图谱的边构建,以及院内病历文本转结构化字段的口径设计。

临床实体与关系标注数据的样例与交付形态?

产品页提供真实脱敏样例:一份门诊病历片段上的十九个实体提及与十二条关系提及,正文随标注一同交付,字符跨度按 Unicode 码位半开区间定位。支持数据集交付、API 调用、Token 计量与可信数据空间连接器。

临床实体与关系标注数据怎么定制?起订量多少?

标注层次可选只交付实体提及,或实体加关系提及,再按实体类型、关系类型、文书类型、断言与体验者属性、跨句关系比例定制,起订量为 5,000 份标注文书,数据量按项目商定。可先申请开源子集或测试数据核对标注指南口径。

临床实体与关系标注数据可以和哪些产品组合?

常与临床文书分类与章节切分数据(SHP-MED-05-031)取得被标注文书的版本与章节坐标,与诊断、操作与药品术语标准化数据(SHP-MED-05-034)把标注出的术语接到标准编码体系,与临床信息抽取训练数据(SHP-MED-06-038)延伸为任务化训练样本。

[08]

获取方式

  • 有明确科研/临床项目:提供研究方向与所需字段范围,可先申请开源子集用于可行性验证。
  • 有明确数据智能场景:提供模型或应用场景,可先申请测试数据与接入方式完成联调。
  • 许可:评估与研究使用许可。

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