这是什么
病理全切片图像与对应病理诊断逐例配对,图像已去除可识别信息,按数据持有机构的授权范围供应。资料以病理病例为单位,病例下的多张切片各自编号。瘤种与染色类型在授权范围内选定。
每张切片记标本类型、取材部位、染色方法,以及扫描倍率与像素间距。图像以 SVS、NDPI 或 TIFF 等全切片格式保存,并记最大层像素尺寸。病理诊断保留报告原文,附 ICD-O-3 形态学编码与组织学分级;免疫组化逐个抗体记判读结果。
区域标注在切片上勾画多边形,坐标以最大层像素计,每个区域带类别标签。标注与复核人员的资质随记录登记,要求病理科主治医师及以上。
长什么样
样本来自左乳外上象限的粗针穿刺标本,诊断为浸润性乳腺癌(非特殊类型),组织学 2 级,形态学编码 8500/3。
记录下挂五张 40× 扫描的切片:一张 HE,四张免疫组化,分别是 ER、PR、HER2 与 Ki-67,各写判读结果。HE 切片上有两个区域标注,标签为“浸润性癌”和“间质”,各由四个顶点坐标围成。末尾注明主治医师标注、副主任医师复核。
看数据
字段
| 字段 | 含义 | 取值与格式 |
|---|---|---|
| 病例编号 | 去标识化后的病理病例编号 | H 加 10 位数字 |
| 切片号 | 单张切片的编号,同一病例多张切片各自编号 | S 加 4 位以上数字 |
| 标本类型 / 取材部位 | 标本获取方式与来源部位 | 如 粗针穿刺、手术切除;左乳外上象限 |
| 染色 | 切片的染色方法 | HE,或免疫组化抗体名称如 ER、PR、HER2、Ki-67 |
| 扫描倍率 | 全切片扫描的物镜倍率与像素间距 | 20× 或 40×;µm/像素 |
| 文件格式 / 图像尺寸 | 全切片文件格式与最大层像素尺寸 | SVS、NDPI、TIFF;宽×高 |
| 病理诊断 | 病理报告的诊断原文 | 中文自由文本 |
| icdo3形态学 | 病理诊断对应的 ICD-O-3 形态学编码 | 4 位数字加行为码,如 8500/3 |
| 组织学分级 | 按 Nottingham 分级系统的分级 | 1 级、2 级、3 级 |
| 免疫组化结果 | 各抗体的判读结果 | 阳性比例、染色强度或评分 |
| 区域标注 | 在切片上勾画的区域及其类别 | 数组,每项含标签、多边形顶点坐标(最大层像素) |
| 标注者资质 | 标注与复核人员的专业资质 | 病理科主治医师及以上 |
一条记录
{
"病例编号": "H2026041108",
"标本类型": "粗针穿刺",
"取材部位": "左乳外上象限",
"icd10": "C50.4",
"病理诊断": "(左乳肿物穿刺)浸润性乳腺癌,非特殊类型,组织学 2 级。",
"icdo3形态学": "8500/3",
"组织学分级": "2 级",
"切片": [
{
"切片号": "S0012",
"文件": "slides/S0012.svs",
"染色": "HE",
"扫描倍率": "40×",
"像素间距(µm)": 0.25,
"图像尺寸": "61440×38912",
"层级数": 4
},
{
"切片号": "S0013",
"文件": "slides/S0013.svs",
"染色": "ER",
"扫描倍率": "40×",
"像素间距(µm)": 0.25,
"判读": "阳性,约 90%,强"
},
{
"切片号": "S0014",
"文件": "slides/S0014.svs",
"染色": "PR",
"扫描倍率": "40×",
"像素间距(µm)": 0.25,
"判读": "阳性,约 60%,中等"
},
{
"切片号": "S0015",
"文件": "slides/S0015.svs",
"染色": "HER2",
"扫描倍率": "40×",
"像素间距(µm)": 0.25,
"判读": "1+"
},
{
"切片号": "S0016",
"文件": "slides/S0016.svs",
"染色": "Ki-67",
"扫描倍率": "40×",
"像素间距(µm)": 0.25,
"判读": "约 25%"
}
],
"区域标注": [
{
"切片号": "S0012",
"标签": "浸润性癌",
"多边形": [
[18432, 10240],
[24576, 9728],
[26112, 15360],
[19968, 16896]
]
},
{
"切片号": "S0012",
"标签": "间质",
"多边形": [
[30720, 12288],
[34816, 12288],
[34816, 16384],
[30720, 16384]
]
}
],
"标注者资质": "病理科主治医师标注,副主任医师复核"
}样本
内容与字段
- 领域
- 医疗真实世界
- 类别
- A 真实世界临床记录
- 形态
- 数据集
- 样本获取
- 提供字段说明
页内展示的是样本预览;完整样本按“样本获取”一栏的方式提供。
瘤种与染色类型按需
持续增加
- 01
说明
工作 目标 提供任务或研究问题、所需资料、使用阶段与预期交付格式。
- 02
核对
样本 与 条件 确认来源、使用范围、内容覆盖、版本与缺失,区分已有材料和需加工的部分。
- 03
约定
试制 与 接收 按项目确认批次、质量检查、验收方式与交付安排。