标本与切片索引.csv
把病例、标本、玻片、图像与诊断连接起来。
| 病例 | 标本 | 玻片 | 图像路径 | 报告 |
|---|---|---|---|---|
| P001 | S001 | SL001 | slides/SL001/ | PT001 v1 |
文件提示
从标本定位切片与报告,再关联辅助检测和最终诊断。
病理科资料按层级组织:病例之下是取材标本,标本之下是玻片与切片图像,再到辅助检测与病理诊断报告,逐级相连。瘤种与组织类型按项目选取。
取材部位、标本编号、玻片编号在每一层都有保留。同一病例的不同标本、同一份报告的不同版本,各有独立关联;报告更正后,旧版本的引用不被覆盖。诊断名称附标准编码与体系版本。
核对包括切片图像能否读取、标本与报告是否配对。同一病例的多张切片若分入不同数据划分,交付前检查重叠。辅助检测结果与病理诊断分别记录,出自哪个标本、哪张玻片,都能追到。
主表是标本与切片索引,一行连起病例、标本、玻片、图像路径和报告版本。切片图像按玻片编号分目录存放,格式按约定提供;病理报告与辅助检测报告分开存放。
病理报告以 JSON 保存,除报告编号、版本、签发时间外,还写明对应的标本编号与玻片编号,正文分“所见”与“结论”。诊断编码表列原诊断名称、编码体系、编码值与核对状态。
连接病理图像、玻片、标本与报告诊断,用于数字病理训练、病例整合及检测结果比对。
把病例、标本、玻片、图像与诊断连接起来。
| 病例 | 标本 | 玻片 | 图像路径 | 报告 |
|---|---|---|---|---|
| P001 | S001 | SL001 | slides/SL001/ | PT001 v1 |
从标本定位切片与报告,再关联辅助检测和最终诊断。
保存约定可供的图像、波形或原始文件,索引用于定位。
slides/SL001/
└── 切片图像(约定格式)
reports/PT001.json
标本与切片索引.csv
此样例仅展示组织方式,未展示实际切片像素用影像或信号软件打开原件;通过检查编号和清单核对报告。
保留报告正文、版本、检查和签发时间。
{
"报告编号": "PT001",
"版本": "v1",
"签发时间": "2025-03-01 11:30",
"正文": {
"所见": "来源报告的所见正文",
"结论": "来源报告的结论正文"
},
"标本编号": "S001",
"玻片编号": "SL001"
}按检查编号配对原件;修订报告保留版本,不直接覆盖。
让原始诊断、操作名称和采用的标准版本可追溯。
| 病例 | 原名称 | 编码体系 | 编码值 | 核对状态 |
|---|---|---|---|---|
| P001 | 来源诊断名称 | ICD-10 · 约定版本 | 依来源记录提供 | 待版本核对 |
先确认编码体系版本,再用于分组或与标准术语关联。
说明观察单位、文件之间如何连接以及使用范围。
交付前用样本和说明共同核对读取方式。
文件清单包含文件名称、版本和校验信息。
| 文件 | 版本 | 记录/页数 | 校验信息 |
|---|---|---|---|
| 标本与切片索引.csv | 版本 v1 | 实际交付时填写 | 实际交付时生成 |
| 影像与原始资料/ | 版本 v1 | 实际交付时填写 | 实际交付时生成 |
| 报告.jsonl | 版本 v1 | 实际交付时填写 | 实际交付时生成 |
| 诊断与操作编码.csv | 版本 v1 | 实际交付时填写 | 实际交付时生成 |
| 使用说明.md | 版本 v1 | 实际交付时填写 | 实际交付时生成 |
| 文件与版本清单.csv | 版本 v1 | 实际交付时填写 | 实际交付时生成 |
接收时检查文件齐全、版本一致,再导入或开始任务。
页内展示的是样本预览;完整样本按“样本获取”一栏的方式提供。
瘤种与组织类型按需
持续增加
病例、取材部位、标本、切片和报告按层级对应
核对图像可读性和标本配对,划分时检查同一病例多张切片的重叠;报告更正不能静默覆盖旧引用。
提供任务或研究问题、所需资料、使用阶段与预期交付格式。
确认来源、使用范围、内容覆盖、版本与缺失,区分已有材料和需加工的部分。
按项目确认批次、质量检查、验收方式与交付安排。