这是什么
专科医生在去标识化的影像和病理切片上完成的标注。标注类型包括腹部 CT 的解剖结构与病灶分割、乳腺 DCE-MRI 病灶的逐层分割,以及病理免疫组化判读与诊断逻辑。
分割以掩膜文件交付,与原始影像同矩阵、同间距、同方向。每个体素的取值对照一份带版本号的标签体系,体系写明每类结构的勾画规则,例如肝脏含肝内血管分支、不含下腔静脉和胆囊。多发病灶按实例逐个记录层面范围、体积和最大径,并注明所依据的期相或序列;乳腺病灶另记时间—信号强度曲线类型。
免疫组化判读记录着色比例、强度和评分,判读逻辑按步骤写出,从镜下所见推到结论。每条标注署明标注者与复核者,均为专科主治医师及以上;双人标注的一致性以 Dice 系数或判读一致率给出。
长什么样
一例上腹部 CT 增强的标注文件:门静脉期影像,矩阵 512×512×184,体素间距 0.78、0.78、1.0 毫米,掩膜为 NIfTI 格式。肝脏病灶实例 1 位于第 96 至 118 层,体积 12.6 mL,最大径 31.4 mm,判读依据为动脉期明显强化、门静脉期及延迟期廓清、可见包膜;肝脏分割 Dice 0.97。另一条是乳腺癌 HER2 判读:约 15% 浸润性癌细胞呈弱至中等完整膜着色,按四步推到 2+,建议原位杂交检测。
看数据
字段
| 字段 | 含义 | 取值与格式 |
|---|---|---|
| 病例编号 | 去标识化后的病例编号 | C 加 10 位数字 |
| 标注类型 | 本条标注的任务类别 | 腹部 CT 解剖与病灶分割、乳腺 DCE-MRI 病灶逐层分割、免疫组化判读、病理诊断 |
| 影像 / 掩膜文件 | 原始影像与分割掩膜的文件路径 | NIfTI(.nii.gz);掩膜与影像同矩阵、同间距 |
| 标签值 | 掩膜中每个体素的类别编号 | 0–255 整数,对照标签体系 |
| 病灶实例 | 同一标签下多个病灶的逐个记录 | 实例号、层面范围、体积、最大径 |
| 期相 / 序列 | 分割所依据的期相或序列 | CT 平扫、动脉期、门静脉期;MRI 增强早期减影等 |
| 时间—信号强度曲线类型 | 乳腺 DCE-MRI 病灶的强化曲线 | Ⅰ 型持续上升、Ⅱ 型平台、Ⅲ 型流出 |
| 免疫组化判读 | 抗体的着色比例、强度与评分 | 如 HER2 0、1+、2+、3+ |
| 判读逻辑 | 从镜下所见到结论的逐步依据 | 数组,按步骤列出 |
| 标注者 / 复核者 | 标注与复核医师的专业资质 | 专科主治医师及以上 |
| 一致性 | 双人标注之间的重合度或一致率 | Dice 系数或判读一致率 |
标签体系
| 标签值 | 名称 | 勾画规则 |
|---|---|---|
| 0 | 背景 | 未归入以下任何类别的体素 |
| 1 | 肝脏 | 含肝内血管分支,不含下腔静脉和胆囊 |
| 2 | 脾脏 | 沿脾包膜勾画 |
| 3 | 胰腺 | 含胰头、钩突、胰体、胰尾,不含周围脂肪 |
| 4 | 左肾 | 含肾实质与肾盂 |
| 5 | 右肾 | 含肾实质与肾盂 |
| 6 | 胆囊 | 含胆囊壁与腔内容物 |
| 7 | 肝脏病灶 | 沿病灶外缘勾画,多发病灶按实例分别编号 |
标注文件
json
{
"病例编号": "C2026050611",
"检查": "上腹部 CT 增强",
"影像": "images/C2026050611_portal.nii.gz",
"期相": "门静脉期",
"矩阵": [
512,
512,
184
],
"体素间距(mm)": [
0.78,
0.78,
1.0
],
"掩膜": "labels/C2026050611_seg.nii.gz",
"掩膜格式": "NIfTI,uint8,与影像同矩阵、同间距、同方向",
"标签体系版本": "2.1",
"病灶实例": [
{
"实例": 1,
"标签值": 7,
"层面范围": [
96,
118
],
"体积(mL)": 12.6,
"最大径(mm)": 31.4,
"影像判读": "考虑肝细胞癌",
"判读依据": [
"动脉期明显强化",
"门静脉期及延迟期廓清",
"可见包膜"
]
}
],
"标注者": "放射科主治医师甲",
"复核者": "放射科副主任医师乙",
"一致性": {
"指标": "Dice",
"肝脏": 0.97,
"肝脏病灶": 0.88
}
}免疫组化判读记录
{
"病例编号": "C2026051207",
"标注类型": "免疫组化判读",
"切片": "slides/S0215.svs",
"抗体": "HER2",
"病理诊断": "浸润性乳腺癌,非特殊类型",
"镜下所见": "约 15% 的浸润性癌细胞呈弱至中等强度的完整细胞膜着色",
"判读逻辑": [
"只评估浸润性癌区域,排除导管原位癌成分",
"着色为完整细胞膜,强度为弱至中等",
"着色细胞比例超过 10%",
"符合 HER2 2+ 标准,结果不确定,需原位杂交检测"
],
"判读结果": "2+",
"后续建议": "行 HER2 原位杂交检测",
"标注者": "病理科主治医师丙",
"复核者": "病理科主任医师丁"
}样本
内容与字段
- 领域
- 医疗真实世界
- 类别
- E 专家标注与判断
- 形态
- 数据集
- 样本获取
- 申请后提供
页内展示的是样本预览;完整样本按“样本获取”一栏的方式提供。
标注类型
腹部 CT 解剖与病灶、乳腺 DCE-MRI 病灶逐层分割、病理免疫组化判读与诊断逻辑等
持续增加
- 01
说明
工作 目标 提供任务或研究问题、所需资料、使用阶段与预期交付格式。
- 02
核对
样本 与 条件 确认来源、使用范围、内容覆盖、版本与缺失,区分已有材料和需加工的部分。
- 03
约定
试制 与 接收 按项目确认批次、质量检查、验收方式与交付安排。
相关伙伴与机构

