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医疗语料 3.0 专家判断与专业任务 · 专家标注与判断

影像与病理专家标注数据集

专科医生完成的病灶分割、解剖结构标注、免疫组化判读与病理诊断标注。

真实脱敏标注与衍生可定制

这是什么

专科医生在去标识化的影像和病理切片上完成的标注。标注类型包括腹部 CT 的解剖结构与病灶分割、乳腺 DCE-MRI 病灶的逐层分割,以及病理免疫组化判读与诊断逻辑。

分割以掩膜文件交付,与原始影像同矩阵、同间距、同方向。每个体素的取值对照一份带版本号的标签体系,体系写明每类结构的勾画规则,例如肝脏含肝内血管分支、不含下腔静脉和胆囊。多发病灶按实例逐个记录层面范围、体积和最大径,并注明所依据的期相或序列;乳腺病灶另记时间—信号强度曲线类型。

免疫组化判读记录着色比例、强度和评分,判读逻辑按步骤写出,从镜下所见推到结论。每条标注署明标注者与复核者,均为专科主治医师及以上;双人标注的一致性以 Dice 系数或判读一致率给出。

长什么样

一例上腹部 CT 增强的标注文件:门静脉期影像,矩阵 512×512×184,体素间距 0.78、0.78、1.0 毫米,掩膜为 NIfTI 格式。肝脏病灶实例 1 位于第 96 至 118 层,体积 12.6 mL,最大径 31.4 mm,判读依据为动脉期明显强化、门静脉期及延迟期廓清、可见包膜;肝脏分割 Dice 0.97。另一条是乳腺癌 HER2 判读:约 15% 浸润性癌细胞呈弱至中等完整膜着色,按四步推到 2+,建议原位杂交检测。

看数据

字段

字段含义取值与格式
病例编号去标识化后的病例编号C 加 10 位数字
标注类型本条标注的任务类别腹部 CT 解剖与病灶分割、乳腺 DCE-MRI 病灶逐层分割、免疫组化判读、病理诊断
影像 / 掩膜文件原始影像与分割掩膜的文件路径NIfTI(.nii.gz);掩膜与影像同矩阵、同间距
标签值掩膜中每个体素的类别编号0–255 整数,对照标签体系
病灶实例同一标签下多个病灶的逐个记录实例号、层面范围、体积、最大径
期相 / 序列分割所依据的期相或序列CT 平扫、动脉期、门静脉期;MRI 增强早期减影等
时间—信号强度曲线类型乳腺 DCE-MRI 病灶的强化曲线Ⅰ 型持续上升、Ⅱ 型平台、Ⅲ 型流出
免疫组化判读抗体的着色比例、强度与评分如 HER2 0、1+、2+、3+
判读逻辑从镜下所见到结论的逐步依据数组,按步骤列出
标注者 / 复核者标注与复核医师的专业资质专科主治医师及以上
一致性双人标注之间的重合度或一致率Dice 系数或判读一致率

标签体系

标签值名称勾画规则
0背景未归入以下任何类别的体素
1肝脏含肝内血管分支,不含下腔静脉和胆囊
2脾脏沿脾包膜勾画
3胰腺含胰头、钩突、胰体、胰尾,不含周围脂肪
4左肾含肾实质与肾盂
5右肾含肾实质与肾盂
6胆囊含胆囊壁与腔内容物
7肝脏病灶沿病灶外缘勾画,多发病灶按实例分别编号

标注文件

json

{
  "病例编号": "C2026050611",
  "检查": "上腹部 CT 增强",
  "影像": "images/C2026050611_portal.nii.gz",
  "期相": "门静脉期",
  "矩阵": [
    512,
    512,
    184
  ],
  "体素间距(mm)": [
    0.78,
    0.78,
    1.0
  ],
  "掩膜": "labels/C2026050611_seg.nii.gz",
  "掩膜格式": "NIfTI,uint8,与影像同矩阵、同间距、同方向",
  "标签体系版本": "2.1",
  "病灶实例": [
    {
      "实例": 1,
      "标签值": 7,
      "层面范围": [
        96,
        118
      ],
      "体积(mL)": 12.6,
      "最大径(mm)": 31.4,
      "影像判读": "考虑肝细胞癌",
      "判读依据": [
        "动脉期明显强化",
        "门静脉期及延迟期廓清",
        "可见包膜"
      ]
    }
  ],
  "标注者": "放射科主治医师甲",
  "复核者": "放射科副主任医师乙",
  "一致性": {
    "指标": "Dice",
    "肝脏": 0.97,
    "肝脏病灶": 0.88
  }
}

免疫组化判读记录

{
  "病例编号": "C2026051207",
  "标注类型": "免疫组化判读",
  "切片": "slides/S0215.svs",
  "抗体": "HER2",
  "病理诊断": "浸润性乳腺癌,非特殊类型",
  "镜下所见": "约 15% 的浸润性癌细胞呈弱至中等强度的完整细胞膜着色",
  "判读逻辑": [
    "只评估浸润性癌区域,排除导管原位癌成分",
    "着色为完整细胞膜,强度为弱至中等",
    "着色细胞比例超过 10%",
    "符合 HER2 2+ 标准,结果不确定,需原位杂交检测"
  ],
  "判读结果": "2+",
  "后续建议": "行 HER2 原位杂交检测",
  "标注者": "病理科主治医师丙",
  "复核者": "病理科主任医师丁"
}

样本

内容与字段

领域
医疗真实世界
类别
E 专家标注与判断
形态
数据集
样本获取
申请后提供

页内展示的是样本预览;完整样本按“样本获取”一栏的方式提供。

标注类型

腹部 CT 解剖与病灶、乳腺 DCE-MRI 病灶逐层分割、病理免疫组化判读与诊断逻辑等

持续增加

使用与获取

状态
可定制
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  1. 01

    说明工作目标

    提供任务或研究问题、所需资料、使用阶段与预期交付格式。

  2. 02

    核对样本与条件

    确认来源、使用范围、内容覆盖、版本与缺失,区分已有材料和需加工的部分。

  3. 03

    约定试制与接收

    按项目确认批次、质量检查、验收方式与交付安排。

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